血流感染中肺炎克雷伯菌的耐药基因检测及同源性分析

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目的:了解蚌埠医学院第一附属医院住院患者全血标本中分离出的MRKP临床分布特征及其对常用抗菌药物的耐药情况;分析肺炎克雷伯菌携带的β-内酰胺酶及β-内酰胺酶耐药基因型;探讨全血标本中肺炎克雷伯菌的同源性以研究其分子流行病学特征;为临床合理使用抗菌药物及减少耐药菌株的传播提供参考依据。方法:1.收集蚌埠医学院第一附属医院2017年1月2019年2月临床全血标本中非重复分离的MRKP。并对菌株借助基质辅助激光解析电离飞行时间质谱仪(MALDI-TOF-MS)进行鉴定复合。2.采用Vitek-2 Compact全自动微生物药敏分析仪及其配套药敏卡检测肺炎克雷伯菌对常用抗菌药物的敏感性。根据美国临床实验室标准协会(CLSI)推荐的药敏纸片扩散法(K-B法)筛选产β-内酰胺酶菌株:纸片确证试验检测ESBLs,头孢西丁三维确证试验检测AmpC酶,碳青霉烯类抗菌药物灭活试验(mCIM法和eCIM法)检测碳青霉烯酶。采用聚合酶链式反应(PCR)技术检测β-内酰胺酶耐药基因。3.对肠杆菌科细菌基因重复序列(ERIC)借助聚合酶链式反应(PCR)技术进行菌株同源性分析。结果:1.收集临床全血标本分离培养出的肺炎克雷伯菌共155株,经筛选最终获得符合菌株MRKP 93株,主要科室分布在重症监护室(ICU)、急诊内科等科室。2.药敏结果显示:对头孢类抗菌药物的耐药率高于74.19%;对亚胺培南耐药率达67.74%;对氨曲南的耐药率81.72%;对其它喹诺酮类、氨基糖苷类等药物的耐药率均高于65%。3.产酶试验结果显示:经纸片确证试验检出产ESBLs阳性菌株24株;经三维试验检出产AmpC酶阳性菌株36株;经mCIM试验检出产碳青霉烯酶阳性菌株65株,经eCIM试验检出产金属碳青霉烯酶阳性菌株11株;三种酶均产的仅有11株。4.产酶基因分析结果:A类β-内酰胺酶检出含KPC基因63株、SHV基因70株、TEM基因66株,CTX-M基因11株,GES、VEB基因均未检出;B类金属β-内酰胺酶检出产IMP基因16株,未检测到VIM、NDM-1基因;C类β-内酰胺酶即AmpC酶检出含DHA基因20株,未检出含FOX、ACC基因;D类β-内酰胺酶含OXA-48基因未检出。检出含有三种不同耐药基因37株,四种、五种不同耐药基因各为11株。5.阳性产物经NCBI基因库查询和BLAST比对确认:KPC型扩增产物均属于KPC-2型,与源自大肠埃希菌菌株(序列号:MH411118.1)相似性最高,同源性为100%;SHV型扩增产物可确定为SHV-11型,与源自肺炎克雷伯菌菌株(序列号:MH733892.1)相似性最高,为100%同源;TEM型扩增产物可确定为TEM-1型,与源自大肠埃希菌菌株(序列号:MK405592.1)相似性最高,同源性为100%;DHA型扩增产物可确认为DHA-1型,与源自肠沙门菌菌株(序列号:NG-049055.1)相似性最高,100%同源性。6.ERIC-PCR图谱分型显示:93株MRKP之间存在着克隆株,可分为12个型别(以AK、B1表示),其中B型48株、F型16株、I型8株、D型4株、A型3株,其余型别各2株,主要发生在ICU(23株)、急诊内科(14株)和急诊外科(7株)。结论:1.93株MRKP主要分布于ICU、急诊内科等科室,应注意加强相关科室的感染控制,防止院内感染的爆发流行。2.93株MRKP的耐药现象较严重,且检出的耐药基因型均携带两种及以上β-内酰胺酶耐药基因,以KPC+SHV+TEM组合最多见,提示在此类细菌感染严重的情况下,可选用的抗生素有限,临床医生要高度重视。3.93株MRKP之间存在着克隆播散株,其中B型为优势克隆株,相关科室及部门应高度重视,加强我院感染控制力度,减少不必要的科室与科室之间的转诊治疗次数。
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