论文部分内容阅读
目的:为探究急性胰腺炎与复发性急性胰腺炎潜在的miRNA和lncRNA相关分子发病机制,构建miRNA与lncRNA相互作用网络,为在基因层面探索治疗胰腺疾病的方法和新型药物的研发做出贡献。方法:本项目拟通过高通量转录组测序(RNA-Seq)技术对健康人群对照组血液样本(5例)、急性胰腺炎(AP)患者(5例)和复发性急性胰腺炎(ARP)患者血液样本(5例)中的miRNA和lncRNA进行比较研究。结果:与对照组相比,AP组共获得差异mRNA 2780个,存在1807个表达上调的基因,973个表达下调的基因;存在1065个差异lncRNA,其中包含592个lncRNA表现为表达上调,473个表现为表达下调;存在37个表达差异的miRNA,其中17个表现为表达上调,20个出现表达下调。ARP组共获得差异mRNA 1195个,其中表达上调基因919个,276个基因表达下调;发现409个差异lncRNA,其中307个lncRNA表现为表达上调,102个表现出表达下调;13个存在差异的miRNA,包含11个表达上调的miRNA,及2个表达下调的miRNA。两组中共有的差异mRNA 909个,差异lncRNA 315个,差异miRNA有12个,且各差异基因在两组中的表达趋势一致。lncRNA-mRNA共表达的差异基因参与嗜中性粒细胞脱颗粒(neutrophil degranulation)、适应性免疫反应(adaptive immune response)等免疫相关的生物过程,此外,还在如下这些通路富集:如代谢途径(Metabolic pathways)、(细胞因子受体相互作用)Cytokine-cytokine receptor interaction等。针对ARP特有基因行差异表达分析,挖掘出286个mRNA,94个lncRNA,1个miRNA(hsa-miR-342-5p)表现出表达下调。经lncRNA-mRNA共表达分析,揭示差异基因的生物过程由蛋氨酸代谢过程(methionine metabolic process)参与,且富集在如下通路:氧化磷酸化(Oxidative phosphorylation)、代谢途径(Metabolic pathways)等。结论:共有的ceRNA网络中,lncRNA LUCAT1/NEAT1-miR-16-2-3p-AATK/ENTPD1/CREB5调控网络可能参与胰腺炎的发病机制。而针对miR-342-5p进行ceRNA网络分析提示,lncRNA DGCR9/ASAP1-IT2-miR-342-5p-ABCC5/MAP2K6K网络可能参与ARP疾病的发病机制。