甘蓝型油菜千粒重QTL TSWA7b的精细定位和候选基因鉴定

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种子粒重/大小是油菜产量的三大构成因子之一,是典型的受多基因控制的数量性状。在油菜中,尽管目前有大量粒重QTL定位,但大多粒重基因还未被克隆,因此油菜种子大小调控的机理还不是很清楚。在前期研究中,本实验室对A7染色体上的粒重QTL TSA7b展开了初步定位和近等基因系的构建工作。在此基础上本研究继续对该QTL进行精细定位与候选基因的筛选。主要研究结果如下:1、近等基因系的构建:结合初步定位结果,在构建好的BCsF1和BC6F1代近等基因系材料的基础上,选择QTL TSWA7b位点内杂合的单株,以DH22为轮回亲本,创建了 BC6F1和BC7F1高世代材料,并利用12对覆盖整个QTL区段的分子标记进行基因型分析,构建了 BC6F1和BC7F1代近等基因系。2、局部遗传连锁图谱的构建:利用针对QTL区段开发的InDel标记,对两个定位群体BC3F2和BC6F2材料分别随机选择单株进行基因型鉴定,并创建TSWA7b位点局部遗传连锁图谱。在BC3F2代群体中随机选择了 192个单株,利用16个共显性标记,构建图谱总长度为12.5 cM,标记间最小距离为0.3 cM,平均距离为0.78 cM。在BC6F2代随机群体中,共分析了 20个共显性标记,图谱总长度为12.3 cM,标记间最小距离为0.3 cM,平均距离为0.61 cM。两个遗传连锁图谱中相同分子标记的相对位置是一致的。根据从BC3F2、BC4F3和BC3F4三个定位群体中挑选出的QTL位点纯合重组交换单株基因型与表现型联合作图发现,控制油菜千粒重性状的基因位于标记BnA767和BnA753之间,物理距离190 kb。3、在精细定位区段内共有24个预测的基因,根据亲本等位基因的序列比较分析发现,其中有20个基因在CDS序列中发生碱基变异,且17个基因的碱基变异会导致氨基酸的变异。根据拟南芥同源基因的注释功能,我们将一个与生长素相关的蛋白初步确定为该QTL的候选基因。开展甘蓝型油菜A7位点的粒重主效QTL进行精细定位和候选基因鉴定工作,有助于粒重遗传机理的解析和分子研究,提高油菜的产量,为油菜的进化研究提供理论依据。
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