猪脾脏抗菌肽SSH19的分离鉴定及其生物信息学分析

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抗菌肽(Antimicrobial peptides,AMPs)在许多生物体中自然存在,是针对外来微生物(例如真菌,细菌,病毒等)入侵的天然防御系统的主要活性成分之一。抗菌肽表现出广谱抗菌活性,其抗菌机制独特而复杂,不易导致耐药性产生。本研究从猪脾脏中分离纯化出新型抗菌肽,多肽合成后对其进行抗菌活性检测,从而筛选出活性较强的抗菌肽,而后通过一系列生物信息学相关软件对其理化性质、二级结构、跨膜区、信号肽、细胞内定位、修饰位点等方面特性进行分析,为将其开发成新型抗菌药物奠定基础。  本研究通过无菌操作方法获得猪脾脏,运用组织匀浆、超声破碎、乙酸浸提和高速离心方法获得脾脏粗提物,后经阳离子交换层析和反向高效液相色谱(RP-HPLC)对粗提物进行分离、纯化,用大肠杆菌(ATCC8099)、金黄色葡萄球菌(ATCC6538)作为抗菌活性试验的指示菌株,获得了一个抑菌活性较强的抗菌肽。经MALDI-TOF-MS质谱鉴定和序列比对分析得出,获得该抗菌肽的氨基酸序列,将其命名为SSH19。利用多肽合成仪合成猪脾脏抗菌肽SSH19,进行抗菌活性检测。结果表明,合成的抗菌肽SSH19对大肠杆菌(ATCC8099)、金黄色葡萄球菌(ATCC6538)有很好的抑菌效果。通过生物信息学相关软件对抗菌肽 SSH19进行理化特性、二级结构、跨膜区、信号肽、胞内定位、糖基化、泛素化、酶切位点和疏水性等相关数据进行分析,得出抗菌肽SSH19带7个正电荷,存在两个磷酸化位点、6个酶切位点、具亲水性,存在76%螺旋区域。
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