布尔网络的长程相关性及可控性研究

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复杂生物系统一个重要特性是可以产生具有长程相关性的波动信号。布尔网络是基因调控网络的一种重要模拟仿真模型,已经成功应用于仿真模拟许多真实生物网络系统。在本文中,我们基于布尔网络研究网络的动态行为,结果发现在小噪声环境下,布尔网络系统可以从有序的布朗噪声过度到1/f,最终到达混乱的高斯白噪声。这从理论上证明了布尔网络作为基因调控网络的模型是合理的。在生理学中,正常运行的健康系统可以输出复杂的具有长程相关性的1/f波动信号。有研究表明偏离这种波动与生物的疾病和衰老具有一定的联系。为了找到这种波动的产生机理,我们从网络吸引子结构角度出发,经仿真分析得出具有多个吸引子的网络更加容易产生1/f。进一步研究分析得知,具有1/f波动的网络的可控性比没有1/f波动网络更高。已有的理论分析表明,有序函数对网络的的运行及其动态行为具有重要的影响。Post类函数是目前发现的数量最大的一种有序函数,其缺点是它仅反映了基因之间的正调控机制。本文在Post类函数的基础上,将其扩展为一种同时具有正负调控机制的函数类。仿真结果表明:扩展的Post类函数在维持网络的有序性及长程相关性方面,和原有的Post类函数以及渠化函数类似。同时与已有的Post类和渠化函数相比,新扩展的Post类函数量最多。从进化的角度,新扩展的函数更有可能成为自然进化选择的调控方式。最后通过对八种真实生物系统布尔网络模型函数分布的研究,也部分的证实了这一结论。
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