TET2基因突变及SNP rs2454206在急性髓系白血病中的研究

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【目的】1.探讨急性髓系白血病(AML)患者中TET2基因突变发生率,分析其临床特征及预后。2.研究了TET2基因突变与其他酪氨酸激酶相关基因(C-KIT、FLT3,JAKV617F),核磷蛋白基因(NPM1),MLL-PTD基因,IDH1基因突变之间是否具有相关性。3.研究TET2基因SNP rs2454206位点在正常核型AML患者中的临床意义。【方法】采集2005年2月至2007年8月我院经MICM分型确诊192例初治AML患者骨髓单个核细胞,正常对照取100例正常健康人骨髓单个核细胞。采用基因组DNA-PCR方法扩增TET2基因3-11号外显子,IDH1基因4号外显子直接基因测序分析;同时检测NPM1、FLT3、C-KIT、JAK-2V617F及MLL基因突变情况;收集192例AML患者的临床与实验室检查资料,了解其临床特征,随访患者的疗效、复发及长期生存情况,并分组进行统计学比较分析,观察患者临床特征及预后的影响。【结果】1 . TET2基因突变的发生率及其临床意义。192例AML患者中,25例患者检测到TET2基因突变,突变率为13.0 % [95% CI (6.70%~20.38%)]。突变组中位年龄为54岁,而未突变组中位年龄为41岁,两者存在着显著的差异(P= 0.010)。突变组(TET2mut)初诊外周血血红蛋白量(Hb)高于未突变组(TET2wt)分别为84 (70~108) g/L和70 (55~87) g/L,有明显的统计学差异(P= 0.032);两者在性别、分型、初诊外周血白细胞计数、血小板计数、外周血原始细胞、骨髓原始细胞比例及染色体核型并没有明显的统计学差异。TET2基因突变与NPM1基因突变有一定的相关性,但与C-KIT、FLT3及JAK2V617F突变并无明显的相关性。在正常核型(CN-AML)患者中,TET2mut患者第一疗程化疗完全缓解率(CR)和3年总生存率(OS)均低于TET2wt,差异有明显统计学意义。2. TET2基因SNP位点研究。通过对TET2基因进行测序分析发现5种编码区SNP位点,其中4种为非同义编码SNP,SNP(1039S/S)位点为首次发现,通过对发现的SNP进行筛查分析发现SNP rs2454206(TET2AG/GG)的发生率为42.1%,而在100名正常对照组中发生率为38.0%,两者差异无明显统计学意义。在CN-AML中发现存在SNP rs2454206(TET2AG/GG)患者初诊外周血白细胞计数较低(P=0.037),血红蛋白(Hb)较高(P<0.01),且存在SNP rs2454206(TET2AG/GG)患者的完全缓解率(CR)、无复发生存率及总生存率(OS)均高于SNP rs2454206(TET2AA)患者。【结论】TET2基因在初治AML中突变率约为13% ,TET2基因突变更易存在于年龄偏大AML患者中。TET2基因突变时很少有Ⅰ类基因(FLT3、C-KIT)同时突变,而易于Ⅲ类基因(NPM1基因)突变同时存在。在CN-AML患者中,发生TET2基因突变患者不易诱导缓解,易复发且生存期短。在CN-AML患者中,存在SNP rs2454206(TET2AG/GG)患者其白细胞偏低,血红蛋白偏高,缓解率较高,生存时间较长。
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