水稻广谱抗稻瘟病基因Pigm的图位克隆与功能研究

来源 :中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所 中国科学院上海生命科学研究院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:milksnake
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
稻瘟病是由子囊菌Magnaporthe orzye引起的,广泛分布于水稻栽培的国家和地区,是水稻上最重要的病害之一,是限制水稻高产稳产的重要因素。目前控制稻瘟病的最经济有效的方法是寻找利用具有广谱抗性的抗源或抗性基因。所以定位与克隆广谱抗稻瘟病基因对于认识植物与病原菌的互作机制以及抗病育种都是非常重要的。谷梅4是上个世纪60年代选育的持久抗病品种,经过遗传分析表明它对9个不同系谱的小种抗性均由1对显性抗病基因控制,均来自同一位点Pigm,并把该基因初步定位在第6染色体上4.3cM的区域。 基于初定位的结果,继续扩大群体,利用1250株谷梅4号与感病粳稻Maratelli的BC1F2感病单株,根据已经测序的日本晴与9311序列设计的InDel和CAPS标记,把Pigm定位在标记C5483和C0428间,与标记S29742、C24901、PC22705共分离,并根据日本晴的PAC/BAC构建精细定位图谱。在日本晴的基因组中标记C5483和C0428间的距离为70kb,包含6个NBS-LRR类抗病基因,籼稻9311的基因组中含有5个NBS-LRR类抗病基因。根据以前的定位结果发现Pi2、Pi9、Piz、pizt,Pi26在此区域,通过等位性测验表明Pigm与Pi2和Pi9可能是等位或紧密连锁。 构建水稻谷梅4的基因组文库,获得了58850个克隆,平均插入片断104kb,覆盖水稻基因组14倍,利用引物R35395与R54246筛选该基因组文库共获得7个候选阳性克隆,通过末端测序和酶切图谱鉴定把覆盖Pigm位点的BAC30进行shot-gun测序,BAC30克隆的插入片断全长为104650bp,基因预测其包含9个NBS-LRR抗病基因和1个Ty3/gyspy类的反转录转座子。根据BAC30的序列设计定位标记并结合BC2F2的基因型和表型鉴定最后把Pigm定位在S29742与S48590间包含9个候选基因的区域,与标记S26205和M18849共分离,并构建覆盖Pigm的物理图谱。 为了验证候选基因的功能,构建以pCAMBIA1301为载体,插入片断为15-30kb的亚克隆表达文库,利用PCR技术筛选出9个包含不同候选基因的亚克隆,以感病的水稻日本晴为受体进行遗传转化。每个转化的克隆分别获得50株阳性苗。经过苗期和成株期接种鉴定,初步确定R6为有抗性功能的候选基因,R4和R8的功能还不能确定。同时通过筛选谷梅4的γ辐射诱变的M2群体42550株,获得4个感病单株,也验证突变位点发生在R4,R6,R8。已经克隆的广谱抗病基因Pi9和Pi2位点是包含9个NBS-LRR类基因的抗病基因簇,但比较分析发现Pigm位点是包含13个NBS-LRR类基因的抗病基因簇。比Pi2多4个抗病基因,而这4个抗病基因是原有成员基因的重复。通过聚类分析发现Pigm位点的不同抗病基因成员与Pi9和Pi2位点的对应抗病基因呈现非常一致的同源性。它们是由同一祖先进化而来,Pigm位点在后来的人为改良中聚积了更多抗病基因,导致其表现广谱的抗性。 利用分子标记辅助选择的方法,把Pigm基因转育到其他品种中育成了6个品系,利用25个稻瘟病菌株接种鉴定表明含有Pigm基因的品系与谷梅4表现一致的抗性。可以利用分子标记加快Pigm与其他抗病基因的聚合。
其他文献
总结4例二尖瓣脱垂患者经导管行二尖瓣修复术的围手术期护理.护理要点:术前做好心理护理,改善心力衰竭症状;术后关注患者的主诉,加强血流动力学的监护,做好并发症护理和康复
超宽带雷达(Ultra-Wideband Radar)具有强穿透能力与高距离向分辨率等优点,在穿墙动目标跟踪、反恐维稳、生命救援、地质勘测、城市管线探测等多种军事及民用领域中具有巨大的
MicroRNA作用位点预测是microRNA研究中十分重要的内容。目前大多数的microRNA作用位点预测方法主要基于“种子”序列互补和物种间的保守性来进行预测。而新近一些研究表明,
目的 探讨关注和解释疗法对胃肠道肿瘤患者心理弹性水平和焦虑抑郁的改善效果.方法 选择宁夏回族自治区某三级甲等医院住院的胃肠道肿瘤患者作为研究对象,按随机数字表法分为
阐述了ICU患者家属沟通管理的重要性,综述了国内外ICU患者家属沟通管理的模式,并从ICU患者家属沟通需增强预见性、融入同理心、增设丧亲护理服务等方面提出沟通管理的建议与
提高电解加工电源的品质一直是国内外近年来电解加工研究中的主要目标和影响 电解加工精度的关键问题。高频窄脉冲电流电解加工采用高频窄脉冲电流源代替传统的 直流电
综述开业护士主导的群组管理在慢性疾病管理中的应用研究,从目标人群、团队成员组成与分工、保密性、运用方式与效果、服务收费等多个方面进行总结,旨在为国内开展专科护士主
微加工工艺技术始终是MEMS发展中基础性和先导性兼具的研究工作,为MEMS的发展提供支撑。作为已经成为MEMS主流的硅工艺,键合工艺(BondingTechnology)和硅深刻蚀技术(ICP)的发展
对国际认证哺乳顾问的定义、起源与认证、角色和实践环境、对母乳喂养的影响及在实际工作中遇到的挑战进行综述,旨在为构建符合中国国情的哺乳顾问在医院的工作模式提供参考.
环境胁迫诱导的脯氨酸积累是植物一种非常显著的代谢适应机制。和其他胁迫应答反应一样,脯氨酸积累也受到各种植物激素和信号分子的调控,如脱落酸、钙离子等。本论文的研究目