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动物肠道中定殖的细菌群落对宿主的消化、防御和免疫功能起着重要的调控作用。七鳃鳗因其特殊的进化地位和适应性免疫系统,而在脊椎动物起源与进化及免疫反应机制等诸多领域都具有较高的研究价值。目前为止,还未有关于七鳃鳗肠道共生细菌与其适应性免疫系统相互作用机制的研究。本论文分别利用七鳃鳗肠道16S rDNA片段V3-V4区测序和构建肠道细菌16S rDNA文库的方法分析了七鳃鳗肠道细菌组成。结果表明,七鳃鳗肠道菌群结构相对简单,只鉴定到8个属的细菌,分别为:气单胞菌属(Aeromonas),希瓦氏菌属(Shewanella),肠杆菌属(Enterobacteria),噬几丁质杆菌(Chitinophagaceae_unclassified),不动杆菌属(Acinetobacter),耶尔森氏菌属(Yersinia),弧菌属(Vibrio)和Candidatus Bacilloplasma。其中气单胞菌属和噬几丁质杆菌是七鳃鳗肠道中的绝对优势菌群。随后利用传统的细菌体外培养的方法,分离纯化获得一株七鳃鳗肠道共生菌,并对分离菌株进行了分子鉴定,结合形态分析及系统发育分析结果,将其命名为气单胞菌属(Aeromonas sp.)lam-2。本文建立了qPCR定量检测气单胞菌数量的体系,与PBS对照组相比,经LPS刺激后,七鳃鳗肠道中气单胞菌数量上升2倍,且气单胞菌刺激使得七鳃鳗可变淋巴细胞受体分子表达上调,证明气单胞菌是参与七鳃鳗适应性免疫反应的关键肠道共生菌之一。为了分析肠道气单胞菌调控七鳃鳗适应性免疫的分子机制,利用lable-free定量蛋白质组学技术鉴定了气单胞菌刺激后七鳃鳗外周血白细胞总蛋白质组的变化,共鉴定到34个差异表达蛋白,并对其进行了功能注释、基因本体(GO)分析及参与的KEGG信号通路分析;进一步检测了差异表达蛋白质在mRNA水平上的表达。推测STAT3为参与七鳃鳗适应性免疫调控的关键蛋白质分子。综上,本研究在确定七鳃鳗肠道共生菌组成的基础上,通过分析肠道关键菌群气单胞菌对七鳃鳗外周血白细胞总蛋白质组表达的影响,鉴定获得了参与七鳃鳗适应性免疫反应的关键蛋白质分子。本研究利用肠道共生菌与宿主免疫系统互作为切入点拓宽了对七鳃鳗免疫学研究的途径,为七鳃鳗适应性免疫系统的起源和进化研究提供了理论基础。