水稻少分蘖突变体lt8601和卷叶突变体rl8354的遗传分析和基因定位

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水稻分蘖和叶型是影响产量和塑造理想株型的的两个重要农艺性状。水稻分蘖数直接影响有效穗数,进而影响水稻单位面积产量;叶片是水稻光合作用的重要场所,是水稻重要的“源”组织。对水稻分蘖和叶型突变体基因的研究能够为超高产育种提供理论和材料基础。本研究利用EMS(甲基磺酸乙酯)诱变籼稻品种676R和188R分别得到一份少分蘖突变体(low tillering)lt8601和一份卷叶突变体(rolling leaf)rl8354,主要结果如下:1.水稻少分蘖突变体lt8601的遗传分析和基因定位(1)表型及农艺性状:lt8601在苗期无明显表型差异,分蘖期表现出少分蘖性状;农艺性状调查结果显示:与野生型676R相比,成熟期lt8601的单株有效穗数、株高、穗长、每穗着粒数、千粒重和结实率都表现出显著减少,分别减少了78.7%、25.3%、24.5%、29.7%、4.8%和6.7%,说明lt8601突变基因对植株生长产生了较大影响。(2)遗传分析:lt8601突变体与野生型亲本676R杂交,所有F1群体植株为正常的分蘖表型,F2群体表现正常分蘖植株和少分蘖植株两种类型,统计分析结果表明正常分蘖植株和少分蘖植株比例符合3:1,说明该性状是受1对隐性核基因控制。(3)基因定位:lt8601突变体与正常植株日本晴(NP)做杂交构建F2定位群体,通过SSR和InDel标记最终将该基因定位于RM023和S2两个引物之间的第1染色体短臂,遗传距离为2.3 cM和1.1cM,物理距离约为1026kb。(4)高通量测序结合MutMap方法进行基因定位及遴选候选基因结果显示:12条染色体上的SNP指数散点图只有第1染色体短臂上的SNP位点呈单峰分布,说明基因突变位点与第1染色体连锁,与前期定位结果相一致。进一步分析显示在第1染色体短臂仅有1个位点的突变引起氨基酸变化,且该位点位于定位区间,基因编码一个未知功能蛋白质,是新基因。因此,推测该突变基因可能是引起少分蘖突变性状的候选基因,暂且命名为lt8601。2.水稻卷叶突变体rl8354的遗传分析与基因定位(1)表型及农艺性状:rl8354表现出卷叶表型。农艺性状调查结果显示:突变体rl8354株高、穗长和千粒重都显著降低,分别降低了18.6%、18.1%和7.6%。单株有效穗数、每穗着粒数和结实率较野生型188R下降了12.3%、3.1%和4.0%。(2)遗传分析:rl8354突变体与野生型亲本188R杂交,F1群体植株为正常的叶型,F2群体表现正常叶型植株和卷叶植株两种类型,统计分析结果表明正常叶型植株和卷叶植株比例符合3:1,说明该性状是受1对隐性核基因控制。(3)基因定位:rl8354突变体与粳稻品种日本晴(NP)做杂交构建F2定位群体,将突变该基因定位于InDel标记H3和RM6641之间的第2染色体短臂,遗传距离为2.3cM和5.6cM,物理距离约为1189kb。该区间没有卷叶基因克隆的报道,故认为是一个新的水稻卷叶基因,暂命名为rl8354。
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