组蛋白去乙酰化酶参与番茄抗青枯病的机制研究

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目的 由茄科雷尔氏菌(Ralstonia solanacearum)感染番茄引起的青枯病(Bacterial wilt)是导致番茄减产的重要原因;组蛋白去乙酰化酶(Histone deacetylases,HDACs)主要参与植物的形态发育和应对冷、干旱、抗病等外界胁迫过程;本论文通过生物信息学研究发现番茄含有15个HDACs,通过组织表达、氧化胁迫,及抗感病品种接种青枯菌条件下乙酰化修饰变化和抗病Marker基因Ch IP-QPCR分析,对组蛋白乙酰化参与番茄抗青枯病的机制进行研究,为利用分子生物学技术和基因工程手段改良番茄青枯病抗性奠定坚实的基础。方法 利用生物信息学分析番茄组蛋白去乙酰化酶相关基因,并通过GEO芯片分析以及Q-PCR验证番茄各个组织及胁迫处理条件下的表达差异。利用Western-blot分析抗感品种中组蛋白去乙酰化酶基因的表达差异、运用Ch IP和Q-PCR分析抗青枯病Marker基因的表达差异及H3和H4乙酰化修饰变化。构建p Can Gmyc-Sl HDT3和p YLRNAi5-35S-Sl HDT3表达载体。通过筛选获得最适的卡那霉素和潮霉素浓度,对番茄Henz 1706遗传转化体系进行优化。在获得转基因植株后,利用普通PCR对番茄Henz 1706基因组中外源基因新霉素磷酸转移酶基因(NptⅡ)和潮霉素磷酸转移酶(HPT)基因进行检测。结果 1.通过生物信息学分析得到15个番茄组蛋白去乙酰化酶基因,存在组织表达差异且受氧化胁迫和青枯病响应。2.在接种青枯菌条件下,Sl HDA6、Sl HDA9和Sl HDA10在抗病品种中上调表达,感病品种下调表达;Sl HDA8、Sl HDT1、Sl HDT3和Sl HSRT1在抗病品种中下调表达,感病品种上调表达;其它基因在抗感品种均上调表达。3.在接种青枯菌条件下,ERF、WRKY等转录因子和激素通路Marker基因在抗病品种上调表达,感病品种下调表达;其中转录因子Sl CBF1、Sl Pti5、Sl WRKY39、Sl WRKY80表达差异最大。4.转录因子ERF,如Sl CBF1、Sl Pti5等乙酰化水平(H3ac、H4ac)在抗病品种中增加且通过乙酰化修饰参与抗番茄青枯病的过程。5.组蛋白去乙酰化酶抑制剂(TSA)处理可促使番茄感病品种的抗病性增加。6.Henz 1706番茄遗传转化体系中最适的卡那霉素和潮霉素筛选浓度:20 mg/L Kan和4 mg/L Hyg。7.成功构建p Can Gmyc-Sl HDT3和p YLRNAi5-35S-Sl HDT3表达载体;分别获得p Can Gmyc-Sl HDT3和p YLRNAi 5-35S-Sl HDT3阳性转化植株5株和6株。结论 本研究通过番茄组蛋白去乙酰化酶相关基因的生物信息学和氧化胁迫分析,阐明番茄组蛋白去乙酰化酶成员组成及其在氧化胁迫中的关系;通过比较番茄抗病和感病品种间的组蛋白去乙酰化基因的差异、接种青枯菌条件下抗病Marker基因的组蛋白修饰变化、以及TSA处理条件下抗病情况,国内外首次阐明抗病基因在番茄抗感病品种中组蛋白乙酰化的修饰变化,初步研究了番茄组蛋白去乙酰化酶参与番茄抗青枯病的分子机制。
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