农业产业链组织作为一种新兴的农工商一体化组织,它能够加强农户和企业以及市场之间的联系,如在荷兰和美国等发达国家以及在阿根廷、巴西和南非等发展中国家取得很好的应用,效果显著。农户位于产业链的起点,其选择何种产业链组织模式直接影响整个产业链的管理效率。农业产业链上核心企业竞争力的强弱往往关系到整个农业产业竞争力的强弱,而核心企业采取何种产业链组织模式与企业竞争力的大小直接相关。从现有的研究来看,将柠檬产业的发展纳入到农业产业链管理之中进行系统研究,特别是基于农户和企业等微观视角对柠檬产业链组织模式选择进行研究的比较少。本研究以安岳县柠檬种植户和柠檬加工企业为主要研究对象,通过分析研究,笔者提出针对性强且行之有效的政策建议,旨在提高柠檬种植户和加工企业的产业链参与力度,使产业链上相关主体形成稳定的利益联结关系,提高整个柠檬产业链管理水平,促进安岳柠檬产业又好又快地发展。本文定性分析了柠檬产业链组织模式的现状,弄清楚安岳县柠檬种植户和下游主体、柠檬加工企业与其上下游各主体的联结方式和联结的紧密程度,并分析了影响加工企业组织模式选择的因素；采用多元Logistic回归方法分析了柠檬种植户产业链组织模式选择意愿的影响因索；以四川华通柠檬有限公司为例,运用层次分析法为该公司选择了最佳的产业链组织模式。研究结果表明当前阶段种植户和加工企业的产业链参与度较低,各相关行为主体联结较为松散；柠檬种植户的组织模式选择意愿不同程度地受到种植户个人基本特征、生产经营特征、交易成本特征和其他特征等因素影响：加工企业的组织模式选择分别受到供应商(销售商)信用状况和企业生产设备专用性程度等因素影响；最后的个案分析结果显示四川华通柠檬有限公司在上游产业链组织模式选择中应选择合作组织模式,在下游产业链组织模式选择中应选择企业一体化组织模式。在以上分析的基础上,笔者提出了加大农村教育投入,提高柠檬利,植户的受教育水平；不断强化柠檬种植户的市场主体地位；加大政策宣传力度,促使柠檬种植户改变传统观念,选择紧密型组织模式；加大政策支持力度,为柠檬产业链上各利益主体提供良好的外部环境等政策建议。