松材线虫乙酰胆碱酯酶ace-2基因的cDNA克隆与序列分析

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乙酰胆碱酯酶(acetylcholinesterase,AChE, EC3.1.1.7)是生物神经传导中的一种关键性的酶,该酶能特异性降解乙酰胆碱(acetylcholine, ACh),终止神经递质对突触后膜的兴奋作用,保证神经信号在生物体内的正常传递。有机磷与氨基甲酸酯类化合物是线虫AChE的强力抑制剂,能够通过与活性位点的丝氨酸残基形成共价键而抑制AChE。使其对ACh的乙酰化作用无法进行,从而破坏了正常的神经传导作用,最终导致线虫的死亡。AChE-2为线虫体内的4种AChE中最重要的一种,其编码基因为ace-2。本论文对松材线虫(Bursaphelenchus xylophilus)ace-2进行了研究,主要研究结果如下:1、以采自广州的松材线虫为材料,通过收集在培养皿上盖内侧水珠中繁殖的松材线虫,将其与灰葡萄孢(Botrytis cinerea)完全分开,提取了松材线虫的总RNA,使用逆转录PCR(RT-PCR)和快速扩增cDNA末端(Rapid amplification of cDNA ends, RACE)技术,结合降落PCR和巢式PCR方法,获得了一条包括完整3’端的乙酰胆碱酯酶ace-2 cDNA序列(GenBank登录号:FJ947083)和另一条乙酰胆碱酯酶基因的部分序列。2、运用生物信息学软件对前者进行了初步的分析。该序列长度为1880bp,通过与其他线虫的ace-2基因的cDNA进行序列比对,发现该序列的模板RNA并非成熟的mRNA,而是mRNA前体。本实验所收集的松材线虫,包含了从卵到成虫各生长阶段的虫体,且在线虫未死亡前采用液氮迅速冷冻保存,这导致了mRNA前体的存在。预测了该序列的3个内含子区域及剪接方式,去除内含子序列后得到了1767bp的核苷酸序列,该序列编码长度为554个氨基酸的序列,3’端的终止密码子TAA之后还有100bp的非编码序列,其中poly(A)尾巴长度为18bp。使用VectorNTI 10.3比对了几种线虫的AChE-2序列,推断出松材线虫AChE-2约含620个氨基酸,即有长度约为70个氨基酸的N端序列没有得到。3、比较了几种线虫AChE-2的氨基酸序列,这些序列的保守区和多变区界限非常明显,其多变区一是集中在360-410bp的位置,二是在640-700bp的位置,且在720bp以后的整个氨基酸序列的C端,序列相似性非常低。其中甘薯茎线虫AChE-2与松材线虫AChE-2的同源性最高。
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