【摘 要】
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本试验从口蹄疫病毒疫苗株FMDV/O/NMxw/10/99和FMDV/O/NMzg/7/99乳鼠传代毒中提取病毒RNA,采用RT-PCR法分段扩增口蹄疫病毒的3ABC和3D-3,UTR基因片段,然后进行克隆和测序。用
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本试验从口蹄疫病毒疫苗株FMDV/O/NMxw/10/99和FMDV/O/NMzg/7/99乳鼠传代毒中提取病毒RNA,采用RT-PCR法分段扩增口蹄疫病毒的3ABC和3D-3,UTR基因片段,然后进行克隆和测序。用DNAStar软件对测定的核苷酸序列进行拼接,获得包含P3区全部基因的序列,O/NMxw/10/99、O/NMzg/7/99毒株P3区基因全长均为2691nt,编码897aa。3A、3B、3C和3D基因分别含有429、213、639、1410nt,分别编码143、71、213及470aa。两毒株3A基因在276～305位缺少30nt,10个氨基酸。在3D编码区末端有整个ORF的终止密码子TAA。O/NMxw/10/99、O/NMzg/7/99 P3编码区核苷酸和氨基酸的同源性分别为95.4%、97.3%。NMxw/10/99、NMzg/7/99与参考序列Chu-Pei、Yunlin/97 P3编码区核苷酸和氨基酸同源性分别在94.8%～96.2%、97.3%～98.2%,与参考序列SAR/2000、JPN/2000、Tibet/CHA/99、TAW/99 B0V、AKS58、Asia1/YNBS/58、C3/Argentina/85和A12/119/Kent/UK/32 P3编码区核苷酸同源性在84.7%～86.9%之间,氨基酸同源性在92.0%～93.9%之间。在各基因中,3A基因突变率最高。3B、3C和3D基因突变率低,序列比较保守,这与各自的功能有一定的关系。P3编码区内A-G和C-T的转换率较高,是点突变的热点核苷酸,是影响氨基酸稳定因素之一。
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