肝细胞癌ceRNA网络的构建及免疫浸润模式的相关性分析

来源 :中国医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xufei037
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:肝细胞癌是一种预后较差的消化系统恶性肿瘤。目前免疫治疗为肝癌患者带来了希望,竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ce RNA)在肿瘤恶性生物学行为中的重要作用已被证实,但在肝癌发生过程中ce RNA网络与免疫微环境的关系仍有待研究。研究方法:本研究首先应用文献计量学分析ce RNA在肿瘤领域的研究背景。然后使用生物信息学,从GEO数据库中下载肝癌circ RNA、mi RNA及m RNA的表达谱数据,利用差异基因建立ce RNA网络,并进行功能富集分析。继而结合TCGA数据库中基因表达及临床数据,构建预后子网络。基于子网络中的靶基因,使用LASSO COX回归分析建立风险预测模型,进而评估其对肝癌患者生存和预后的影响。然后使用ICGC数据库对模型进行生存验证,同时利用实时聚合酶链反应对预后子网络中的m RNA进行扩增验证。此外,我们采用CIBERSORT算法计算肝癌中肿瘤浸润免疫细胞的分布情况,最终通过相关性分析阐明ce RNA子网络中的关键基因与肿瘤浸润免疫细胞及肿瘤免疫抑制因子的关系。结果:文献计量学结果提示肿瘤ce RNA网络研究仍为当前热点,且主要研究集中于我国。然后,通过生物信息学筛选出了具有表达差异的circ RNA、mi RNA和m RNA进行ce RNA网络的构建,功能富集分析结果表明该网络中的基因与免疫反应信号转导等通路有关。同时,我们构建了含有16个节点的预后子网络,聚焦于子网络中的3个靶基因(PSMD10,ESR1和PPARGC1A),构建了风险预测模型,生存曲线、ROC曲线及列线图证实了其预测肝癌患者预后的可行性,单因素及多因素COX回归分析提示了其可作为独立的预后因子,并且上述结果在ICGC数据及临床样本中得到了证实。此外,我们发现了8种肿瘤浸润免疫细胞在肝癌和正常组织中存在显著差异,且ce RNA子网络中的m RNA与不同种类的肿瘤浸润免疫细胞及免疫检查点之间存在密切联系。结论:本研究有望为肝癌发生的机制研究、预后预警标志物的筛选及免疫反应的评估提供参考。
其他文献
目的:蛛网膜下腔出血(Subarachnoid Hemorrhage,SAH)因其高死亡率以及高致残率,成为神经外科中一种危重的出血性脑血管疾病。但由于血脑屏障的存在,使得一般的药物很难作用到病灶,因此,在现有的药物研究的基础上,进一步研究有效的给药方式仍然具有很大的临床意义。本研究中,我们利用小鼠蛛网膜下腔出血模型进行实验,以此来探究负载N-乙酰-丝氨酸-天冬氨酰-脯氨酸(N-Acetyl-Se
学位
目的:探讨远端胰腺切除术(Distal pancreatectomy,DP)后的患者发生临床相关术后胰瘘(Clinically relevant postoperative pancreatic fistulas,CR-POPFs)的危险因素并建立预测术后胰瘘的模型。方法:回顾性分析本院2005年1月-2020年12月DP术后符合纳入及排除标准患者完整病历资料。对可能与CR-POPFs发生的指标进
学位
<正>滇西德宏傣族景颇族自治州位于我国西南边陲,西面、北面、南面都与缅甸联邦紧密相连,在德宏5个县市当中除梁河县以外,其他4个县市都与缅甸接壤,其国境线有503.8公里。滇西德宏地区有24个乡镇,包括600多个村寨与缅甸北部边境山水相连,从而形成“一寨两国、一坝两国”独具特色的自然人文景观。世居于滇西德宏地区的5个世居少数民族:傣族、景颇族、阿昌族、德昂族、傈僳族与缅甸的掸族、克钦族、迈达族、崩龙
期刊
目的:准确预测心脏手术患者术后谵妄(Postoperative Delirium,POD)对临床决策和改善患者预后具有重要临床价值。由于机器学习(Machine Learning,ML)的高精确性及高效性,ML技术正越来越多的被应用到临床医学中。本研究的目标是基于ML算法建立心脏手术患者POD风险预测模型,并验证其有效性。研究方法:本研究依据混淆评估方法(Confusion Assessment
学位
目的:研究给予大鼠肝脏单次大剂量照射以建立大鼠急性放射性肝损伤模型的可行性。并在模型成功建立后,通过蛋白质组学方法全面筛选大鼠肝脏组织受照射后所表达的差异蛋白,寻找与急性放射性肝损伤相关的蛋白质以作为可能的损伤标志物。研究方法:将健康雄性大鼠33只分为3组,3只为对照组不作任何处理,另两组各15只分别给予20Gy和30Gy照射,照射后每组分5天、10天和15天分别取肝脏组织。每组5天、10天和15
学位
目的:研究辐射诱导的多倍体He La细胞的增殖、凋亡、迁移及侵袭的生物学特性,以探讨其在宫颈癌放疗后复发中的潜在作用。研究方法:使用6 MV-X射线分别以7 Gy、14 Gy的剂量照射He La细胞,继续孵育3 d后收集细胞并标记为7 Gy组和14 Gy组,将未经辐射的细胞作为对照组。光镜下观察细胞形态,流式细胞术检测细胞DNA倍性,二苯基四氮唑溴盐(MTT)法检测细胞增殖,Annexin-V/P
学位
目的:对比不同手术时间修复非Trapdoor型眼眶爆裂性骨折的临床果。方法:本研究为回顾性分析,研究对象选自2015年7月至2021年1月在中国人民解放军北部战区总医院眼科行手术治疗的非Trapdoor型眼眶爆裂性骨折患者共172例(172眼),根据不同的手术时间,分为早期组(≤14天)、中期组(15~30天)和晚期组(>30天),其中早期组85例(85眼),中期组57例(57眼),晚期组30例(
学位
数字技术被广泛运用到社区治理体系中,但互联网技术与社区的互动关系、介入社区的方式却鲜少微观个案的研究。对大营街社区自办的微信公众号进行调研,发现该公众号成为记录社区生活的新档案载体,通过形成“时间流”、发掘社区历史和树立典范、在不同社交媒体平台间架构社区互动机制等方式,从而创造性地将微信公众号转化为一种社区数字治理和联结技术的地方性“电子档案”。微信公众号介入基层社会并实现社会治理的重要方式在于运
期刊
研究通过对抖音平台中家务劳动短视频的观察,分析女性博主家庭生活的内容生产场景、制作模式和情感化表达。发现技术对家庭的嵌入使得家庭空间变得“可见”,家庭生活进一步被媒介化。当家庭的日常细节和家务劳动的过程成为互联网平台中被“观看”的对象,原本具有私密性的生活领域转变成一种可参观性的空间及文化,具有了可接近性、可互动性和表演性等新的特征。将媒介的视角引入家的分析,对于探讨新的家庭文化形态及女性与家庭的
期刊
目的:肝硬化患者的止血系统变化复杂。目前的指南和共识推荐血栓弹力图(thromboelastography,TEG)这一全血粘弹性试验评估肝硬化患者的止血状态。本项横断面研究的目的是评估TEG与肝硬化严重程度和门静脉系血栓(portal venous system thrombosis,PVST)之间的相关性。方法:沈阳队列和西安队列分别纳入116例及50例肝硬化患者;在两个队列中分别比较Chil
学位