本论文首先介绍了微微型浮游生物的定义,对聚球藻、微微型真核浮游植物、原绿球藻、异养细菌和病毒在水体中的分布概况做了简要归纳,阐述了海洋底栖环境的研究现状,并提出了本文的主要研究目的。其次介绍了流式细胞术的发展历程,FACScan型流式细胞仪的主要工作原理,以及水样中微微型浮游生物、异养细菌和病毒的流式细胞术测定方法。通过实验,探讨了流式细胞术测定沉积物中异养细菌和病毒的方法,并给出了主要的实验步骤及注意事项。最后根据2006年6月、8月、10月长江口外缺氧区,2006年11月、2007年2月东海中陆架,2006年12月、2007年8月对海南岛东侧河口海域的调查研究,在认知长江口及毗邻海域微微型浮游生物分布状况的同时,探讨其与环境条件之间的相互关系,以及应对复杂环境作出的反应,进一步了解微微型浮游生物在生物地球化学循环中的作用。2006年长江口外缺氧区的调查研究显示,在低氧形成前后,微微型浮游生物的群落结构发生明显变化,聚球藻和病毒的丰度明显增加,且病毒的增加量远大于聚球藻,微微型真核浮游植物的丰度则急剧下降,而异养细菌丰度的变化不明显。对长江口外低氧事件发生前后,低氧区微微型浮游生物和水体物理条件的相关性分析显示,当水体层化明显,水柱中微生物的生命活动以及有机质的降解消耗水体溶解氧,为水体低氧的形成创造了有利条件。在低氧过程中,异养微生物对微食物环的碳能流动贡献较大。对东海中陆架的调查研究显示,冬季,东海陆架区主要受到黑潮水团的控制,微微型浮游植物的丰度在10~3数量级,异养细菌和病毒丰度在10~5数量级。从初冬到末冬,聚球藻和病毒丰度减小一个数量级,而微微型真核浮游植物、原绿球藻和异养细菌的丰度则有所增加。微微型浮游植物生物量的主要贡献者由聚球藻变为原绿球藻,而微生物碳生产量的主要贡献者始终是异养细菌。水体营养盐浓度及微生物相关性分析显示,磷对微微型浮游生物的限制性较大,营养盐浓度增加伴随着微微型浮游植物丰度的下降,而异养微生物可以选择利用无机、有机营养盐。对海南岛东侧南海海域的调查研究显示,原绿球藻在微微型浮游植物中占绝对优势。异养细菌丰度比病毒丰度大一个数量级,两者数量由沿岸向外海增加。对万泉河、文昌河文教河流域上游至入海口的研究调查显示,受到恶劣天气,如台风的影响等,流域有大量的微生物分布,且从河流上游至河口,微生物丰度逐渐降低。冬夏两季,河流水体中微微型浮游生物的分布有着明显的差异,冬季文昌河文教河流域微微型浮游植物丰度小于万泉河水域,而异养细菌和病毒的丰度则大于万泉河水域。夏季流域除入海口有一定量的微生物外,流域上游没有检测到微微型浮游植物。在对长江口、陆架及红树林底栖环境的研究中得知,沉积物含有大量的异养细菌和病毒,异养细菌和病毒丰度均在10~6数量级,对沉积物中有机质的降解利用起着重要作用。可以将长江口外及东海陆架海区的底栖环境分为四个主要区域:长江冲淡水影响区域、江浙沿岸区域、东海内陆架区域、东海中陆架区域。沉积物中微生物丰度及沉积物含水量随着深度的增加,逐渐下降。沉积物中异养微生物的丰度与有机质含量的多少存在一定的正相关性。红树林沉积物含水量小于海洋沉积物,与其特殊生境有关,同时异养细菌和病毒呈负相关,而陆架沉积物中异养细菌和病毒有明显正相关性。沉积物病毒与异养细菌丰度的比值(VBR)大小可以反映沉积物中营养盐程度的高低,由长江口至台湾海峡附近,VBR随纬度减小呈现下降的趋势,从侧面反映了长江冲淡水的影响范围内,营养物质在输运过程中的滞留、沉降效果。