ITS测序分析方法在鉴定临床酵母样真菌中的应用

来源 :广州中医药大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:wrothnpc
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:本课题旨在建立适用于本实验室的临床常见酵母样真菌的ITS基因检测方法,通过与质谱法、API体系和念珠菌显色平板培养法相比,评价其临床应用价值。同时,初步探讨ITS基因测序法直接检测临床标本的应用前景。方法:首先,设计一对针对多种常见酵母样真菌ITS基因的通用引物,要求扩增的目的片段长度约400—600bp,片段的核酸序列具有种间多样性,能到达通过测序来区分不同种酵母样真菌的目的,并以16标准菌株对引物进行测试。其次,收集135株临床的分离阳性菌株,同时用质谱法、API体系和念珠菌显色平板培养法方法进行检测,比较各种鉴定方法的准确率和灵敏度。最后,收集20份经实验室常规鉴定的阳性临床标本,再用ITS基因测序法直接进行鉴定,评价测序分析法直接检测临床样本的鉴定效果。结果:设计的ITS基因扩增引物成功扩增与鉴定出所有的标准菌株。对135株临床分离的阳性菌株的鉴定中,ITS测序、质谱法、API体系和念珠菌显色平板培养法方法阳性率分别为98.5%(133/135),78.5%(106/135),59.3%(80/135),经χ2检验分析,差异有统计学意义(χ2=51.996,P<0.05)。其中有1株MS未能鉴定的菌,经ITS基因扩增测序后,鉴定为皮炎外瓶霉菌。运用ITS测序方法还成功从20份原始标本中鉴定出致病酵母菌,与其他方法的检测结果一致。结论:ITS序列分析方法能快速、准确地鉴定多种临床酵母样真菌。该方法在不经培养,直接从原始标本中进行检测及鉴定的方向上也有重要的应用前景,是一种可促进临床快速诊断致病真菌感染的方法。
其他文献
目的比较双Endobutton钢板及锁骨钩钢板治疗肩锁关节脱位临床价值。方法回顾性分析2010年6月~2013年6月收治的86例RockwoodⅢ型肩锁关节脱位患者的临床资料。其中男性50例,女
近来的研究表明,人类钠离子牛簧胆酸共转运蛋白(NTCP或SLC10A1)是乙型肝炎病毒(HBV)的一个功能性细胞膜受体。体外的过表达以及敲低实验都证明了NTCP能够介导HBV或者包裹了HB
目的 探讨股骨干骨折后脂肪栓塞综合征(FES)的诊断与治疗方法。方法1989~1998年收治的股骨干骨折病人212例,对并发FES的8例病人的临床表现、治疗方法与结果进行描述。结果184例单股骨骨折病人发生FES4例,28例
企业内部审计在当今企业经营方式和信息使用者多元化的情况下,风险日益增加。为了防范审计风险的发生,文章就当前我国企业中存在的内部审计风险进行了分析,并提出了相应的对
GPS精密单点定位(Precise Point Positioning,简称PPP)是上世纪九十年代末发展起来的一种新的GPS定位技术,它集成了GPS标准单点定位和GPS相对定位的技术优势,是GPS定位技术中
目的探讨四肢骨折应用微创经皮锁定加压钢板内固定的临床效果。方法抽取2016年1月至2017年5月期间我院收治的100例四肢骨折患者展开分析,按照入院顺序分为参照组50例和研究组
以白云石为原料,采用消化-分散沉淀-超声震荡法处理后,灼烧制得了纳米氧化镁。对前驱体进行热分析(TG—DTG—DTA),确定了合适的煅烧温度为600℃。研究了分散剂种类及用量、沉淀剂
中西医对过敏性疾病的病因病机、诊断和治疗有着不同的认识:中医认为过敏性疾病是由过敏体质导致的,常根据其症状表现及其病机而确定其病名,治疗上着重调节偏颇的过敏体质;西
法学本科生口才素质是法学本科生专业素质的重要内容。法学本科口才教育具有专业性、模拟性和综合性的基本特征。法学本科学生优秀口才不仅应言之有法、言之有据,而且应言之
[目的]初步分析涪陵榨菜酱油中挥发性香气成分,为其内在质量评价和鉴定提供特征数据。[方法]采用乙醚萃取法提取榨菜酱油中的香气成分,并用气相色谱-质谱联用仪(GC-MS)分析鉴