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为了研究四个黄牛品种的父系和母系起源问题,本实验运用微卫星技术、PCR-RFLP 技术和PCR-SSCP 技术对Y 染色体10 个微卫星位点、线粒体DNA Cytb 基因和Y 染色体基因SRY 基因HMG-box部分序列进行分析,我们得出以下结论: 1 本研究10 个微卫星位点中,INRA124 位点四个黄牛品种都有两种基因型;在UMN2404 位点,黄牛具有85 bp、62 bp、55 bp 三种等位基因,牦牛具有55 bp 等位基因,该等位基因在黄牛中分布频率很低。在UMN0307 位点,在黄牛和牦牛中都没有多态性,但在黄牛和牦牛有各自的基因型,可以用于黄牛和牦牛的分离鉴定;在BMS861位点、UMN0504 位点、UMN1203 位点和UMN3008 位点在牦牛和黄牛中均没有多态性,而且牦牛和黄牛具有相同的基因型。而UMN2303 和UMN0920 位点扩增电泳结果复杂,具有弥散条带。2 对INRA124 位点的分析发现,南阳牛、晋南牛、秦川牛和鲁西牛都有瘤牛和普通牛两个父系起源。南阳牛父系起源中:瘤牛占72.73%,普通牛占27.27%;晋南牛父系起源中:瘤牛占23.33%,普通牛占76.77%;鲁西牛父系起源中:瘤牛占75%,普通牛占25%;秦川牛父系起源中:瘤牛占25.8%,普通牛占74.2%。其中南阳牛和鲁西牛瘤牛起源占主要地位,秦川牛和晋南牛普通牛起源占主要地位。3 UMN2404 位点有三种等位基因,这三种等位基因在四个群体分布频率没有特异性,在瘤牛和普通牛个体中也没有特异性。4 两个微卫星位点等位基因构建六种单倍型,其中H1 型在南阳牛和鲁西牛占主要地位,H2 型在秦川牛和晋南牛占主要地位,在南阳牛和鲁西牛没有检测到H6 型。5 UMN0307 位点在牦牛和普通牛、瘤牛有不同的等位基因,可以用于牦牛和瘤牛、普通牛的分离鉴定;在本实验研究个体中,没有在黄牛中发现和牦牛相同的等位基因,表明至少在这四个群体所检测个体中,没有发现牦牛的父系起源。6 线粒体DNA Cytb 基因的RFLP 发现,黄牛个体在该序列有HinfI 的酶切位点,而牦牛没有该酶切位点。这表明这段序列可以分离牦牛和黄牛,这也表明四个黄牛品种没有牦牛的母系起源。7 黄牛和牦牛SRY 基因HMG-box 部分序列的PCR-SSCP 分析表明,这一段序列在种间没有多态性,表明这段序列非常保守。