生物质能源产业链的发展有两个重要意义:一是,缓解能源供应紧张;二是,促进农户增收,实现农业产业化,有助“三农”问题的解决。基于此,本文对生物质能源产业链的发展进行研究。影响生物质能源产业链发展主要有两个方面的因素:生物质能源开发利用技术和生物质能源产业链上各行为主体的治理。我国生物质能源转换成本还比较高,政府在扶持生物质能源发展上,付出了代价,生物质能源开发利用技术的瓶颈是阻碍我国生物质能源发展的重大因素之一,有待于政府和公司的共同努力,投入人力、财力,共同攻克技术难关。生物质能源产业链是涉农产业链,农户的农产品对该产业的发展至关重要,因此农户的重要性不言而喻。农户能不能稳定和充分的供应农产品已成为制约生物质能源产业链发展的关键因素之一,如何处理好农户与公司的关系将决定生物质能源产业链的发展。在总结产业链治理的基本理论和分析生物质能源产业的基本特征的基础上,对生物质能源产业链中公司与农户关系的治理机制进行分析。分别从纵向一体化、市场契约、战略联盟三种治理方式谈生物质能源产业链中公司与农户的治理,创造性的选取资产专有性、市场结构、管理成本三个维度对三种治理方式进行比较选择。在以上基础上,对所选最优方式进行分析。运用现代博弈论的方法和工具,对生物质能源产业链中公司与农户战略联盟关系的稳定性用博弈树进行分析,并提出“公司+基层政府+农户”的新战略联盟模式,运用领导者模型对这一新模式再次进行稳定性博弈分析。最后,在以上定量分析的基础上,为进一步稳定公司与农户的战略联盟关系,对“公司+基层政府+农户”的模式,分别从政府、公司和农户三个层面提出切实可行的政策建议。