新疆地处中国西部边陲,是我国重要的能源战略基地,是西部经济增长的重要支点,是我国向西开放的重要门户,是我国西北边疆的战略屏障。近年来,由于新疆独特的人文环境、地缘环境,使得新疆的稳定日益受到国内外敌对势力的威胁。然而,边疆稳定问题的产生并不是孤立存在的,而是与经济利益关系紧密联系在一起。改革开放以来,新疆也实行了非均衡发展战略,各地区之间的经济差异越米越大,并对新疆的经济发展以及社会稳定产生了不良影响。因此,我们希望通过实施区域经济协调发展,消除区域经济差异过大对边疆稳定造成的不良影响。研究方法上,本文以区域经济学、政治经济学相关理论为理论基础,首先对边疆稳定与区域经济协调发展的互动关系做了定性分析；其次,以此为基础,对影响新疆稳定的因素做了实证分析；再次,利用因子分析法、聚类分析法、不平等指数法对新疆区域经济差异现状进行了实证分析,并找出影响新疆区域经济差异变化的变动原因；最后,就新疆区域经济差异现状,提出了具有针对性的发展模式以及政策措施。本文通过分析研究得出以下主要结论有：第一,区域经济差异与边疆稳定存在互动关系；第二,经济发展水平呈现出“南低北高”、“沿边低、腹地高”的特点,发达地区与欠发达地区之间的集中连片,区域经济差异呈现出扩大态势等；第三,影响新疆区域经济差异的主要因素有：社会秩序因素、政策因素、制度因素、区位因素、民族文化因素、投资因素、产业结构因素、人力资本因素、对外开放因素等。第四,实现新疆区域经济协调发展模式主要有多极点合作模式、区域经济一体化模式、产业滚动发展模式、出口导向型发展模式、点轴发展模式等。第五,为实现促进新疆区域经济协调发展,维护边疆稳定,应该严厉打击“三股势力”,构建区域经济协调发展的环境,加强交通等基础实施建设,加强区域经济合作,实施西部大开发战略和向西开放战略,培育新的增长极,加大对人力资本的投资力度等。