不同城市化水平地区室内灰尘微生物群落的比较

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背景城市化进程在哮喘和过敏性疾病的发展中起着重要的作用。有研究表明,与生活在城市环境中的儿童相比,生活在农场或经常与农场接触的儿童患哮喘和过敏性疾病的几率更低。人们大部分时间都是在室内度过的,室内微生物群是我们日常生活环境的重要组成部分,它与人类的健康关系密切,因此其组成对直接影响人类健康非常重要。室内灰尘是一种含有大量微生物的无机和有机物质的复杂混合物。长期以来,儿童和成人在环境中暴露于微生物及其成分与许多非传染性的健康影响相关,这些影响对人体健康可能有两方面截然不同的作用:有益或有害。目的比较不同城市化水平地区室内灰尘中细菌群落的主要成分以及多样性;探讨居住者人数、宠物数量以及采样家庭内饲养宠物的时间、城市化水平对室内灰尘微生物群落的影响。方法采用问卷调查方法对我国成年人哮喘等过敏性疾病患病情况进行了调查。采用两种方法收集室内灰尘:室内降尘(SD)采用棉球擦拭法,地面灰尘(FD)采用真空吸尘器收集。室内降尘主要是从中国中部地区的农村(新乡农村XR n=74)和城市地区(新乡城市XU n=33,郑州城市ZU n=32)采集。地面灰尘主要是从澳大利亚采集(珀斯AU n=58)。中国样品采集时间是在2017年7月和8月份,澳大利亚样品采集时间是2017年12月份以及2018年1月份。室内平均温度为27°C,平均湿度为42%。同时,记录所有采样家庭的居民人口数,以及澳大利亚采样家庭的宠物数量以及宠物饲养时间,据此澳大利亚样品分为有宠物的样本(AUP)以及没有宠物的样本(AUNP)。此外,参照2018年《全球化与世界城市研究网络》,根据城市人口比例和国内生产总值对采样地区的城市化水平进行分类。灰尘样品采集好以后用锡箔纸包裹冻存到-80°C冰箱中保存,直至分析。采用CTAB法进行细菌DNA提取,16S rDNA高通量测序技术对室内灰尘菌群进行分析。结果1.问卷调查结果显示,我国城镇地区哮喘检出率显著高于农村地区,差异有统计学意义(P=0.027)。而花粉过敏在三个地区间无显著差异。2.XR地区平均家庭人口数量最多,城市化水平最低;而AU地区平均家庭人口数量最少,但城市化水平最高。3.在门水平上,变形菌门和放线菌门在SD中相对丰度较高:XR(47.62%,15.17%),XU(46.92%,18.76%)以及ZU(40.80%,19.04%)。然而,FD中变形菌门,厚壁军门以及放线菌门相对丰度较高AUP(43.06%,19.46%,16.17%),AUNP(35.78%,20.85%,20.09%)。在属水平上,未辨别出的线粒体,鞘脂单胞菌属,未辨别出的叶绿体以及葡萄球菌属分别是XR,XU,ZU以及AU样品中相对含量最高的菌属。4.XR样品较SD其它样品组丰度和多样性都较高,AUP和AUNP丰度和多样性无显著差异。5.XU,ZU以及AU样品组菌群结构相似性较高。6.SD样品中,代谢通路在城市化程度高的地区其相对丰度较高。7.室内灰尘菌群在门和属水平上且相对丰度大于1%的大多数菌群都与采样家庭人口数量、采样家庭宠物数量以及饲养宠物年限、城市化水平显著相关。8.城市化水平(r~2=0.741 P<0.001)、居民人口数量(r~2=0.311 P<0.001)、宠物数量(r~2=0.550 P<0.001)以及饲养宠物年限(r~2=0.517 P<0.001)与室内灰尘菌群分布显著相关。且城市化水平与室内灰尘菌群分布相关性较强。9.细菌门厚壁菌门、梭杆菌门、芽单胞菌门、疣微菌门和细菌属葡萄球菌属、假单胞菌属、棒状杆菌属、巴尔通氏体属以及链球菌属与城市化水平具有强相关性。结论室内灰尘微生物群落在不同城市化水平地区之间存在显著差异。城市化水平较低的地区,室内灰尘细菌丰富度和多样性较高。居民、宠物、城市化水平与部分室内灰尘微生物群落呈显著相关。与其他环境因子相比,城市化水平对室内灰尘微生物群落的分布相关性较强。
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