香蕉是福建重要的亚热带特色水果，栽培历史悠久，有着很高的经济价值。但由于香蕉为无性繁殖，而且又是多倍体，其遗传背景复杂，生产上常出现同物异名和同名异物现象，品种类型分类混乱，这些都造成了其种质资源保存利利州的困难。本研究利用RAPD分子标记技术对以福建香蕉遗传资源为主的54份材料进行遗传多样性分析。主要研究结果如下：1．利用改良的CTAB方法从香蕉叶片中提取高质量的DNA。2．香蕉RAPD-PCR反应体系的优化。在参考一般RAPD分析反应程序的基础上，经过反复试验，确定适合香蕉PCR扩增程序为：94℃预变性5min；94℃变性1min；38℃退火1min；72℃延伸2min；变性（?）延伸，循环45次；最后72℃延伸2min。PCR扩增的体系（总体积25μL）为：模板DNA 20ng，dNTP 200μmol／L，10×PCR Buffer2.5μL，引物0.20μmol／L，Taq酶0.75U，ddH₂O17.85μL。3．香蕉种质资源的RAPD分析。利用16条随机引物，对香蕉54份遗传资源进行PCR扩增，每条引物均能够产生清晰的条带，共扩增出194条DNA带，其中191条皆为多态性条带，多态性比例为98.45％，如此高的多态性表明香蕉品种间具有丰富的遗传多样性。借助SPSS13.0软件分析RAPD表型数据矩阵，计算各样品间的相似系数，建立亲缘关系聚类树状图。依据此图，以遗传距离GD=0.70为界，将供试香蕉品种分成三大类群：第一类群包括了36份材料，主要为香牙蕉类：第二类群包括了11份材料，以粉蕉和龙牙蕉为主；第三类群包括了7份材料，以大蕉为主。4．利用16条RAPD引物扩增产生的4个特殊标记的存在或缺失，可以鉴定广东湛江巨龙蕉、南丰芭蕉和野生角蕉3份资源。5．筛选出21个香蕉材料可作为核心种质保存，这些材料扩增出来的条带可以代表香蕉种质资源的遗传多样性水平，涵盖了香牙蕉、粉蕉和大蕉这三大类型；除了常见的AAA、AAB和ABB三种基因型外，也包含了AA基因型（海南西贡蕉）；在包含常见栽培种的同时，也包含了漳蕉8号、汕头红蕉和海南巴西蕉等新品种和珍贵品种。