水稻根系相关性状QTL定位

来源 :华南农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jqk1981fjj
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水稻(Oryza sativa L.)是世界上最主要的粮食作物之一,全世界超过一半的人口都以水稻为主食。地面上的重要水稻农艺复杂性状,如产量、抽穗期、育性、抗性等,一直是研究的重点和热点,但作为“隐藏的另一半”—根系性状研究却未能得到足够的重视和关注。强大的根系有助于作物水分和养分的吸收;同时,根系作为感知逆境胁迫的重要器官,与作物抗逆性直接相关,提高水稻品种的抗逆性,才能使其具有更好的生态适应性,从而获得稳产。深入挖掘根系优异性状及其遗传机制,对于水稻根系性状改良具有重要意义。本研究利用水稻浅根品系CHA-1和深根品系H335为亲本,构建的包含195个家系的F2:3代遗传作图群体,利用QTL IciMapping V3.1作图分析软件的完备区间作图法对水稻根系相关性状进行QTL初步定位分析,共定位到29个根系相关性状QTLs,具体研究结果如下:(1)定位到总根长相关的1个QTL,分布在第9染色体上,单个QTL所能解释的表型方差的贡献率为8.01%,加性效应为137.4,命名为qTRL9,与qRV9-2和qR/S9-2位于同一区间;(2)定位到平均直径相关的QTLs共有2个,分布在第5和7染色体上,单个QTL所能解释的表型方差的贡献率为9.49%和21.12%,其中表型贡献率最大的为qRAD5,达到21.12%,加性效应值为0.005,这与qRV5-1位于同一区间,最小的为qRAD7,达到9.49%,加性效应值为0.086,这与qRV7位于同一区间;(3)定位到最大根长相关的QTL共1个,分布在第4染色体上,命名为qMRL4单个QTL所能解释的表型方差的贡献率为18.33%,加性效应值为1.74;(4)定位到根尖数相关的QTLs共8个,分布在第1、3、6、9和11染色体上,分别命名为qRTN1-1、qRTN1-2、qRTN3、qRTN6、qRTN9-1、qRTN9-2、qRTN9-3和qRTN11,单个QTL所能解释的表型方差的贡献率为8.3%-30.63%之间,其中表型贡献率最大的为qRTN1,达到30.63%,加性效应值为30.68;(5)定位到根体积相关的QTLs共5个,分布在第5、7和9染色体上,分别命名为qRV5-1、qRV5-2、qRV7、qRV9-1、qRV9-2,单个QTL所能解释的表型方差的贡献率为9.5%-18.4%之间,其中表型贡献率最大的为qRV9-2,达到18.4%,加性效应值为3.08;(6)定位到根干重相关的QTLs共6个,分布在第1、3、8、9、11和12染色体上,分别命名为qRDW1、qRDW3、qRDW8、qRDW9、qRDW11、qRDW12,单个QTL所能解释的表型方差的贡献率为8.89%-20.59%之间,其中表型贡献率最大的为qRDW3,达到20.59%,加性效应值为0.106;(7)定位到根冠比相关的QTLs共6个,分布在第3、6、8、9和12染色体上,分别命名为qR/S3、qR/S6、qR/S8、qR/S9-1、qR/S9-2和qR/S12,单个QTL所能解释的表型方差的贡献率为8.02%-16.35%之间,其中表型贡献率最大的为qR/S12,达到16.35%,加性效应值为0.08。
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