c-Abl调节可变剪接及无义突变介导的mRNA降解

来源 :中国人民解放军军事医学科学院 解放军军事医学科学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:plutus001
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
c-abl是Abelson鼠白血病病毒原癌基因v-abl在细胞内的同源物,广泛表达于哺乳动物细胞中[1]。其编码产物c-Abl属于非受体酪氨酸激酶家族(non-receptortyrosine kinase family),具有多个功能结构域,如SH3、SH2、ATP结合区、激酶活性区(TK)、富含脯氨酸区、核定位信号区(NLS)、DNA结合区、G-Actin及F-Actin结合区、核输出信号区(NES)等。   DNA损伤反应如离子辐射、顺铂等通过ATM或DNA-PK途径激活细胞核中的c-Abl,诱导细胞周期停滞。在紫外线和TNF-α诱导的应激损伤反应中,c-Abl通过与IκBα的相互作用诱导细胞凋亡。   Abelson超家族还包括另一个成员,Abl相关基因Arg(abelson related gene)。Arg和c-Abl高度同源。   前期研究显示,c-Abl能够与某种剪接因子相互作用,提示c-Abl可能参与调控细胞中的可变剪接过程。   真核生物前体RNA除去内含子连接外显子获得成熟mRNA的过程称为剪接(splicing)。在剪接过程中通过选择不同的剪接位点而产生不同的mRNA异构体,即可变剪接(alternative splicing,AS)。可变剪接是由一种称为剪接体的复合物执行的,该复合物由五种snRNPs(U1,U2,U4,U5,U6)和大量的辅助蛋白组成,通过多种信号精确识别剪接位点完成剪接过程。   可变剪接是基因调控和蛋白质多样性的重要机制,受到多种顺式元件和反式因子的调节。   AS可以产生新的蛋白质,改变蛋白质的结合特性,酶活性,细胞内定位,信号传导功能以及稳定性等。异常的AS可能导致相关疾病的发生。   AS可以使mRNA的阅读框发生改变,产生提前终止密码子(prematuretemination codons,PTC)。含有PTC的mRNA可以通过NMD(nonsense-mediatedmRNA decay)途径得到降解。NMD也是调节基因表达水平的方式,可以作为一种监督机制,使含有PTC的mRNA在翻译成功能缺失的截短蛋白而可能对细胞造成毒害之前就被清除掉,避免对细胞造成损害。   通过RNA干扰获得c-Abl敲低(knockdwon,KD)的人乳腺癌成纤维细胞系MCF-7稳定突变株,将培养细胞提取总RNA,应用Affymetrix外显子芯片检测突变株和野生型细胞中全基因组的剪接变化。经过一定的数据处理步骤,筛选若干重要的基因用RT-PCR方法进行验证,获得了发生可变剪接的基因,初步证实c-Abl对可变剪接的调控作用。对发生可变剪接的基因做了初步的功能探讨,并分析了其可变剪接与c-Abl之间的关系。   在受调控的基因中,发现了3个基因新的可变剪接异构体,其中IL4R、PSMB10以及SRRM1/SRm160通过可变剪接使阅读框发生移码而产生提前终止密码子(premature termination codon,PTC)。IL4R缺失第六个外显子(Ex6),PSMB10和SRRM1/SRm160则分别在Ex6和Ex7、Ex3和Ex4之间发生内含子保留(intronretention),从而使原来的编码框发生改变,出现提前终止。   在人类细胞KD/MCF-7和小鼠DKO(abl和arg双敲除)/MEF中检测各基因PTC剪接异构体的表达,结果显示,在人源细胞MCF-7中,c-Abl的敲低(KD)使SRRM1、PSMB10和IL4R的"PTC+mRNA"相对升高;在小鼠同源基因中,SRRM1和PSMB10的"PTC+mRNA"在c-Abl和Arg双敲除的条件下有较明显的上调,IL4R则没有检测到对应的"PTC+mRNA"。说明这些基因的"PTC+mRNA"的剪接与c-Abl是相关的。   RNA干扰和蛋白质抑制方法证实,SRRM1/SRm160的"PTC+mRNA"通过NMD机制被降解。进一步研究发现,该"PTC+mRNA"在293细胞中具有细胞周期特异性,G1期表达量最高,而在S期及G2/M期较低。   我们还分析了21个已经被证实可以通过NMD降解含PTC剪接异构体的小鼠基因,然后在DKO/MEF细胞中进行验证。结果显示,相对于野生型MEF,在c-Abl和Arg双敲除的DKO细胞中,多达10个基因含有PTC的剪接异构体表达量都有显著的上升,说明c-Abl参与调节基因"PTC+mRNA"的剪接过程,甚至参与调控NMD过程,进一步证明了c-Abl对可变剪接的调节作用。
其他文献
肝癌(HCC)是世界上第五大常见癌症,致死率居第三位,并且肝癌的发病率还在不断上升。肝癌的发生是一个多因素的复杂过程,肝脏组织的丰富血供和旺盛的细胞分裂增殖能力使得肝癌
二十六、对现象的抽象是理念,对具象的抽象是美的质变。二十七、少见多怪,多见不怪。你不是声称对抽象艺术并不理解吗?既然不理解你又将用什么样的理由去反对它呢?既然没有理
  Glycolide is an important molecule,as a precursor to the biodegradable and biocompatible polymers poly(glycolic acid) (PGA) and poly(lactic-co-glycolic acid
会议
激活标记技术(activation tagging)是构建功能获得突变体为研究对象,在植物功能基因组学的研究中具有重要的作用。该技术在模式植物拟南芥中已经得到广泛的应用,但是在油菜中还未见报道。我们以优质高产的油菜品种1244W6为材料,采用浸花蕾方法,将含有激活标记和Basta筛选标记质粒pSKI015的农杆菌进行转化,成功构建了油菜激活标记突变体库。通过Basta筛选,结果共获得约30000个
摘要:本文论述了多媒体在历史教学中的必要性,然后讲述了它在历史教学中的几方面优点。最后,总结在以后的历史教学中,我们既要充分发挥多媒体辅助教学的巨大作用,但也不能过分地依赖这种手段,而应该将传统教学手段和现代化教学手段有机结合起来,找到它们的最佳结合点,从而切实提高历史课堂教学效率。  关键词:多媒体;教学手段;教学效率  中图分类号:G633.51 文献标识码:A 文章编号:1992-7711(
该文对合成邻乙氧基苯酚工艺进行了研究,一是由邻苯二酚和溴乙烷为原料,在水—甲苯二元非均相体系中,以PEG—400为相转移催化剂,于碱条件下合成了邻乙氧基苯酚.产品收率可达8
松乳菇(Lactariusdeliciosus(L.Fr.)Gray)隶属于担子菌亚门(Basidiomycotina)、层菌纲(Hymenomycetes)、伞菌目(Agaricales)、红菇科(Russulaceae)、乳菇属(Lactarius),是一
  Instead of simply covering the wounds,the modern wound dressings could be specially made to exhibit various functions which are beneficial to the healing of
会议
该文研究了甲苯歧化与C芳烃烷基转移反应体系中诸反应的焓变、吉布斯自由能和化学平衡常数,在等温积分管式反应器中研究了诸因素对芳烃总转化率和(B+X)选择性的影响以及β沸
本文通过分析大学英语教学中文化渗透的重要性以及传统外语教学存在的问题,强调在中国大学英语教学中进行文化教学的必要性和教学中文化渗透的具体方法策略,旨在探究教学中适