本研究以甜瓜根围土壤微生物为对象，综合运用系列稀释培养计数法、微生物量碳测定和末端标记限制性片段长度多态性(T-RFLP)方法，分析了三种生防菌Trichodermaharzianum T4、T. harzianum Th2和Paenibacillus polymyxa HY96-2对甜瓜根围土壤微生物生物量和群落结构的影响。 结果表明，T4对甜瓜定植后根围土壤可培养放线菌、开花期可培养细菌和果熟期可培养真菌影响显著。HY96-2对甜瓜定植后可培养放线菌和开花期可培养真菌影响显著。而Th2对甜瓜各生育期根围土壤可培养微生物的影响均不显著。三种生防菌的引入均导致土壤微生物量碳的降低，开花期Th2和T4处理区甜瓜根围土壤微生物量碳比对照分别低了16％和35％，而果熟期HY96-2处理区甜瓜根围土壤微生物量碳比对照低了43％左右。T-RFLP方法检测到甜瓜根围土壤细菌40-60个TRF菌群。哈茨木霉T4和Th2对TRF60菌群均有显著的抑制作用，而对TRF251、TRF513菌群均有显著的促生作用。HY96-2对TRF60、TRF79菌群的影响表现为先促生后抑制，而对TRF251、TRF513菌群先抑制后促生。三种生防菌均能在一定程度上促进甜瓜根围土壤细菌的多样性，其对甜瓜根围土壤细菌多样性和均匀性的影响程度分别在10％和5％以内。 综合分析发现，三种生防菌对甜瓜根围土壤微生物均有一定程度的影响。