目前计算机辅助药物设计(Computer Aided Drug Design，CADD)已经成为新药研发领域不可或缺的工具，本论文的工作就是利用计算机辅助药物设计的方法对雌激素受体(Estrogen Receptor，ER)以及急性毒性构效关系分别进行研究。　　 论文的第一章简单介绍了计算机辅助药物设计一些常用的方法和技术，并且对本论文进行了安排。　　 论文的第二章采用基于结构的药物设计方法设计新的亚型选择性雌激素受体调节剂。首先选取之前经虚拟筛选得到的一个活性化合物作为先导物，采用骨架跃迁的方法设计并合成了四个结构新颖具有雌激素受体活性的化合物，表现出一定亚型选择性。然后利用基于结构的药物设计方法，对新的化合物进行进一步地结构优化。另外，我们课题组之前采用网络推理的方法发现两个老药酮康唑和伊曲康唑为新的雌激素受体配体，本章通过分子对接等研究提出了酮康唑与雌激素受体的结合模式，然后通过分析总结雌激素受体配体的一些关键作用，对这两个药物进行结构改造。　　 论文的第三章，我们采用支持向量机方法，构建了急性毒性多类分类模型以及定量的回归模型。通过对测试集的预测，模型可以较好的预测化合物的毒性类别，也可以通过回归模型比较准确地预测化合物的半数致死剂量。并且通过计算信息熵以及子结构片段频率提出了一些能够表征急性毒性的优势子结构。　　 论文第四章是对本论文工作的总结。