假单胞菌NyZ12降解环己胺初始步骤冗余机制研究

来源 :武汉轻工大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xinhua163
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
环己胺作为一种重要的精细化工中间体,给大气和水体带来了严重的污染,该化合物还具有一定的致癌性。Pseudomonas plecoglossicida NyZ12是一株能利用环己胺为唯一碳源、氮源和能源生长的菌株,其环己胺代谢的分子生物学机理仍未阐述清楚。本实验室在前期研究假单胞菌NyZ12中环己胺的降解途径中,将amo2631克隆到广宿主表达载体pVLT33,在假单胞菌PaW340中表达和纯化,最终成功得到amo2631所表达蛋白,在其转化的过程中,也成功检测到产物环己酮的生成,验证了该基因的功能。然而,采用无痕敲除技术敲除了amo2631后,突变体仍然能够以环己胺为唯一碳氮源良好的生长,仅生长速率受到了一定的影响,表明了该菌株在环己胺的初始代谢步骤中存在代谢冗余机制,即可能含有两个或两个以上的基因共同完成环己胺到环己酮的代谢过程。本论文的目的在于探究环己胺的初始代谢步骤的冗余基因,充分揭示假单胞菌NyZ12代谢环己胺的分子机理。为了达到该目的,采用了生物信息学分析、基因组建库筛选和转座子插入突变体库三种方式筛选环己胺降解相关基因,得到了基因 orf671、orf5356、orf566,orf567以及基因族 orflNl2(orf566、orf567)、四基因簇 orfN4(orf1725、orf1727、orf1728、orf1729)。将上述预测基因克隆至pUC18载体后,全细胞转化使用分光光度计法检测底物环己胺的降解情况,其中orf566和orf671降解较明显,将其克隆至pET表达载体,于BL21(DE3)菌株中诱导表达,并纯化蛋白:将粗酶液进行环己胺底物转化,并用GC-MS检测产物,其中orf671转化产物中成功检测到代谢中间产物环己酮(保留时间3.300min),证明了 为环己胺初始代谢步骤的参与基因之一,其作用机理有待后序研究。而orfN4由于基因片段较大,在pUC18与pET28b表达均难有效表达,故考虑直接无痕敲出。将主要基因orf1727在amo2631突变体NyZ12△4的基础上进行敲除,结果表明,NyZ12△5未失去以环己胺为唯一碳氮源生长的特性,但生长速率明显慢于NyZ12A4,故基因orf1727可能为环己胺代谢相关基因,有待后续研究进一步证实。另外,本论文克隆和异源表达来源于不动杆菌YT-02的环己胺氧化酶,并对其酶学性质进行了研究,该酶分子为二聚体蛋白,分子量约为91 kDa,该酶的最适温度为50℃。但是,该酶是不耐热的,50℃孵育30min后其活性丧失。金属离子Mg2+,Co2+和K+对酶活性具有一定的抑制作用。动力学参数Km和Vmax分别为 0.25±0.02 mM 和 4.3±0.083 μM min-1。
其他文献
临床资料患者男性,26岁,因"突然出现胸背部、左下肢疼痛8h"入院。既往有高血压病史10年,最高210/110mm Hg(1mm Hg=0.133k Pa),平时未规律服药,未检测血压。入院测血压190/110mm H
目的:探讨补肺活血中药方治疗间质性肺疾病合并肺部感染疾病的临床疗效,评价其对肺功能改善的积极影响与作用。方法:选取2014年12月~2016年12月我院接诊的间质性肺疾病合并肺部
背景:研究发现三维有限元分析可用于膝关节生物学研究,但关于股骨内侧髁不同缺损后周围软骨应力变化的研究不多。目的:探讨膝关节股骨内侧髁软骨发生不同缺损前后周围关节软
《我们的父辈》作为第一部以战败国为主视角反映二战的电视剧,在浓重的反思色彩下,建立起战争亲历者和后辈面对历史的敞开对话,反映了当代德国人的集体回忆和自我救赎,对战争
现今,人力资源外包在很多企业中都十分地流行。但在人力资源外包的过程中,存在着一系列的潜在风险,这些又需要运用企业的人力资源部门在企业人力资源外包的事前、事中和事后
中国传统的手工业为何未能发展出现代工厂,是经济史学家们长期关注的一个问题。近年来,一些新的研究对包工制、工头制等传统企业组织形态的历史作用和地位提出了新的看法;传统企
目的针对缩宫素注射剂在临床上可引起过敏性休克,水潴留等过敏反应的发生,考察缩宫素注射剂中的高分子量物质与其过敏反应发生的相关性。方法采用凝胶过滤色谱法对其原料及其
固定资产是高校开展教学的必要保障,随着高校办学高速发展,高校的固定资产也大幅增加。但随之而来的是对固定资产核算和管理带来了很多问题,如资产流失、设备利用率低等。文
一、三个话题的提出我国宪法第五十六条规定:“中华人民共和国公民有依照法律纳税的义务”。公民依法纳税、穷人少缴税、富人多缴税应该不是争论的话题。奇怪的是在2008年的
武术产业发展的区域化模式对武术运动的普及具有重要作用,为了深入探讨这一论题,运用文献资料、专家访谈、逻辑分析等方法,对武术产业区域化发展的现实条件和理论进行分析,并