中国正处在工业化中期，进入中等收入国家阶段，具有危害性、复杂性的突发性事件逐年增多，在一定程度上危害着社会的稳定和发展。同时，随着我国互联网技术的普及和发展，我国网民的数量呈现快速增长趋势，截止到2012年6月，已经达到5.38亿人，连续4年居世界第一。社会大众在面对突发事件时，以网络为平台，进行微博发布、新闻跟贴、论坛发贴、网上签名等方式迅速形成的网络舆情已经成为当前社会一个不容忽视的问题[1]。突发事件反映着当前社会的各种矛盾和热点问题，并通过网络舆情进行表现。网络舆情逐渐成为社会大众表达民意、诉求理由和意识较量的重要渠道，对党和政府有关部门的决策产生越来越大的影响。研究突发事件网络舆情的政府治理，有利于政府采取更合理、有效的方式对突发事件网络舆情产生的负面影响进行治理；有利于为政府提高领导决策能力提供建议和参考；有利于密切党和政府与社会大众的联系；有利于进一步构建社会主义和谐社会。为了对突发事件网络舆情的政府治理方面进行研究，本文将在科学发展观视域下，以科学发展观为指导，以构建和谐社会为主要目标，运用公共管理学、社会学、传播学、法学等学科的基本原理，结合“北京“7·21”暴雨事件”、“四川会理领导‘悬浮照’事件”两个政府治理突发事件网络舆情方面的典型案例进行分析，并借鉴国内、外突发事件网络舆情治理的相关制度和实践经验，以系统动力学、沉默的螺旋、蝴蝶效应等三种相关理论为支撑，采用文献研究法、典型案例分析法以及综合分析法，对政府治理突发事件网络舆情的现状和面临的挑战进行分析。最后根据文章的分析结论，提出对策建议。研究结果表明：（1）科学发展观是政府部门对突发事件网络舆情进行治理的重要指导方针，政府在治理突发事件网络舆情时要始终坚持以人为本、全面发展、协调发展、可持续发展。（2）政府应该从法律与制度层面、组织运作层面、管理与引导层面三个方面，进一步提升面对突发事件网络舆情的治理能力，而其中完善的法律机制则是最重要的治理途径。（3）政府治理突发事件网络舆情的方式主要通过政府和社会共同参与的治理，以政府为主导，社会力量积极参与，从多方面、多角度整合政府、传统媒体、行业组织、网络意见领袖和普通网民的力量，构建突发事件网络舆情治理的社会支持网络。