肺癌患者血小板RNA的差异表达基因研究

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研究目的:血小板是癌症生长时期全身和局部反应的中心因子。血小板通过转移癌症相关的生物分子来影响癌细胞,同时导致了这些癌症相关的生物分子在血小板中的富集,其中包括RNA。基于此,本研究使用二代测序技术对健康体检者与肺癌患者的血小板RNA进行测序,筛选其差异表达基因,并对其进行验证,为以后在肺癌诊断中的应用打下基础。研究方法:第一部分研究收集健康体检者5例、肺癌患者7例,每组各例分别采取外周静脉血6ml,分离出血小板,并利用Trizol法提取总RNA,再用二代测序技术对其进行测序,结合算法对基因表达进行定量,筛选差异表达基因,并对差异表达基因进行聚类分析、Gene Ontology功能分析、KEGG通路富集分析,随后挑选6个显著差异表达基因作为候选基因。第二部分研究纳入4例健康体检者、6例肺癌患者作为验证研究对象。然后利用实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)技术对候选基因进行验证。结果:血小板RNA测序结果发现,实验组与对照组相比,差异表达基因有1076个。Gene Ontology功能分析提示差异表达基因主要与囊泡、生长因子结合等过程相关。KEGG通路富集分析发现,上调的差异表达基因主要与黏着斑、癌症中的转录失调、细胞与细胞外基质及其受体的相互作用等相关;下调的差异表达基因主要与程序性坏死、肿瘤坏死因子、细胞因子及其受体间的相互作用等相关。挑选6个显著差异表达基因,分别是MAOB、MAP2、STK19、NR2F6、VAT1、F8A3。qRT-PCR验证结果与测序结果完全一致。结论:1、本研究基于二代测序技术对健康体检者及肺癌患者的血小板RNA进行测序,结果显示健康体检者与肺癌患者血小板RNA的基因表达谱存在明显差异。2、qRT-PCR验证结果显示,MAOB、MAP2、NR2F6、VAT1在实验组中较对照组表达上调,STK19、F8A3在实验组中较对照组表达下调,验证结果与测序结果一致,提示这些差异表达基因可能参与了肺癌的发生与发展,为下一步的诊断应用研究奠定了基础。
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