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小麦锈病是影响小麦安全生产的一类重要病害，该病发生历史久远，分布广泛，流行性强，危害严重，利用抗病品种是防治小麦锈病最经济、有效的方法。锈菌生理小种毒性的改变是导致抗锈小麦品种丧失抗性的主要原因，查明锈菌生理小种的类型、组成和致病特点，对搞好小麦抗锈育种、品种布局具有重要意义。本文报道小麦叶锈菌（Puccinia triticcina）群体组成、群体毒性和DNA多态性相互关系及病菌生理小种分子鉴定体系三方面的研究结果。 通过对84个国内外叶锈菌标样进行毒性分析，表明2000—2003年小麦叶锈菌生理小种或致病类型以PHT、THT为主。2000年PHT出现频率为46.7％，2002年PHT出现频率为37.5％，2003年PHT出现频率为37.9％。2000年和2002年THT出现频率较低，而2003年THT上升到27.6％。聚类分析结果表明，来自墨西哥的小种M-1、M-2、M-4和澳大利亚的小种（467028）与国内的叶锈菌生理小种差异明显。国内不同小麦种植区的叶锈菌生理小种之间也存在相似性，西北冬麦区的叶锈菌菌系相关系数为0.69，西南冬麦区相关系数为0.66，黄淮海冬麦区相关系数为0.70，长江中下游冬麦区相关系数为0.74，北部冬麦区相关系数为0.77。 采用44个已知抗叶锈病基因的小麦近等基因系或单基因系对33个叶锈菌单孢子堆菌系进行毒性测定，并将结果进行聚类分析，其毒性相关系数在0.57～0.97之间，小种间毒性差异明显：用AFLP方法对33个叶锈菌小种进行DNA多态性分析，将多态性条带进行聚类分析，条带相关系数在0.49～0.97之间，DNA多态性明显。将叶锈菌毒性聚类图和DNA多态性聚类图用NTsyspc2.1（USA）的MXCOMP程序进行相关分析，结果表明，叶锈菌群体毒性与其DNA多态性存在较低相关性，其相关系数为0.2184。 用AFLP方法对来自中国和墨西哥的23个小麦叶锈菌生理小种进行分析，共筛选了64对引物，获得一对引物(M05／E03)可在MFR小种中扩增出一条特异性DNA片段。通过回收、克隆以及测序，其结果表明该片段具有325个碱基。根据该序列设计出SCAR标记引物，对60个叶锈菌生理小种分离物进行回检的结果表明，研制的SCAR标记能够准确区分MFR生理小种。本实验结果为小麦叶锈菌生理小种分子鉴定体系的建立奠定了基础。