酿酒酵母蛋白Hyr1和人源短指相关蛋白Ihh的结构研究

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有机生物体内的活性氧自由基的累积会对细胞的结构组成造成损坏。许多退行性疾病的发生与细胞结构破坏有关。相应的,细胞进化出一些抵抗活性氧自由基的抵御机制。有报告指出酿酒酵母中的Hyr1(或称Gpx3),Gpx1和Gpx2作为谷胱甘肽依赖的磷脂过氧化物酶(PhGpx)特异的解除磷脂过氧化物的毒性。与哺乳动物Gpxs相比,Hyr1有两个明显的特征:(i)Hyr1缺少哺乳动物四聚体解除表面上的寡聚化的loop(除了人类Gpx4)。(ii)Hyr1含有82位半胱氨酸(Cys82),与含有两个半胱氨酸的peroxiredoxin类似。同源结构比较显示,这两个特征对与Trx的特异作用十分重要。 解析了酿酒酵母中Hyr1的晶体结构,去除各向异性的数据后分辨率达到2.02A。整体结构显示Cys36的巯基处于倾向于形成分子内二硫键Cys36-Cys82的位置上。Cys82区域(氨基酸69-86)的电子密度很低,说明此处的柔性很高,有可能作为一个活动的盖子在与下游蛋白的识别过程中通过结构的变化来控制。野生型。Hyr1和Hyr1-C82S的酶活比较也说明了Cys82的重要性。 在脊椎动物中,有三种Hedgehog基因,分别是SonicHedgehog(SHH),IndianHedgehog(IHH)和DesertHedgehog(DHH)。Ihh在脊椎的发育过程中至少有两个重要的作用。首先,在内胚层发育过程中,在内配层形成的前期,Ihh对内脏胚层的分化至关重要。然后,Ihh还调节肠上皮干细胞的分化和增殖。BrachydactylytypeA-1(BDA-1)是根据人类中指(趾)短小或缺失的类型划分的人类遗传性疾病的一种。上海交大贺林教授实验室证实了IHH基因在N端信号结构域的三处错义突变与BDA-1的发生有关。这三个氨基酸在所有的脊椎和非脊椎动物中都是保守的,根据同源结构分析,这三个处于蛋白的表面。已经收集了野生型Ihh、Ihh-突变体1和Ihh-突变体2的蛋白晶体结构X衍射数据。相信这些蛋白3D结构的解析可以为Ihh与其他蛋白的作用方式改变提供一些线索。
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