基于卷积神经网络的PD-L1检测评分的研究

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癌症是影响我国居民健康的主要疾病之一,免疫治疗的发展为癌症患者带来了更多的希望。PD-L1是判断癌症患者是否适宜于免疫治疗的关键生物标志物,所以对PD-L1表达程度的量化在医学领域有着非常重要的研究意义。目前对PD-L1表达程度的量化是通过病理学家直接在显微镜下观察再进行评估的,但人工评分效率低而且主观性较强。为解决以上问题,本文分别对非小细胞肺癌和食管癌两组数据设计了两种基于卷积神经网络的深度学习方法来实现PD-L1自动化评分。具体工作如下:(1)本文严格按照最新的PD-L1国际工作组评分共识和医生意见让专业的标注人员进行数据标注,构建一个新的数据集。以细胞中心为峰值的高斯分布来制作出细胞分类任务的标签,使其可以更好的定位细胞的位置。(2)提出一种基于集成学习的组合模型算法对非小细胞肺癌PD-L1图像进行TPS评分。该组合模型由Res-unet网络和Link Net网络组合构成,首先使用Link Net预测出肿瘤区域分割结果,然后将预测出的肿瘤区域分割结果与原图一起输入进Res-unet网络中预测出细胞分类结果,将细胞分类结果进行处理计算便可以得到TPS评分。最终实验结果得到细胞分类的F1-score值可以达到0.7859,相较于原细胞分类模型有了一定的提高。(3)提出一种基于多任务学习的算法对食管癌PD-L1图像进行CPS评分。基于Res-unet网络和多任务学习方法,将Res-unet网络改进为多任务学习的网络模型,使网络可以同时训练肿瘤区域分割和细胞分类两个任务,由细胞分类结果得到CPS评分。最终对比验证了本文提出的多任务学习方法和集成学习方法的预测效果优于目前的经典语义分割网络。本文提出的两种深度学习模型有较好的预测效果,并且PD-L1评分结果的误差较小,在辅助医生诊断治疗方面有一定的现实意义。
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