利用微卫星分析家兔遗传多样性

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本研究利用6个微卫星DNA标记对七个肉用兔品种和一个杂交群体进行了遗传检测。用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测微卫星的PCR扩增产物,计算了8个群体家兔个体样本在6个微卫星基因座上的等位基因频率、微卫星的多态信息含量(PIC)、各群体遗传杂合度(H)、群体间的遗传距离,并根据遗传距离对这几个群体进行了聚类分析。 结果初步表明,所选择的6个微卫星位点在所检测群体中都表现出了较好的多态性,每个微卫星标记平均检测到13个等位基因,6个微卫星标记的平均多态信息含量为0.5300。八个群体家兔遗传杂合度均较高,其中新西兰白兔的群体杂合度最高(0.6818);表明不同肉兔品种的遗传多样性较丰富,还可进一步进行选择利用。对遗传距离计算的结果表明各品种间的遗传距离较小,彼此之间有较近的亲缘关系。其中哈白兔和天府肉兔与加州兔、比利时白兔、花巨兔的遗传距离较接近,与它们的培育历史相吻合。品种间的聚类结果与群体间已知的血缘关系不太一致,可能是所选用的微卫星位点不太适合于聚类分析。微卫星标Sat12、SOL28在PCR扩增中出现了无效等位基因、标记SOLO3表现出了明显的双重位点现象。为了使试验结果更准确,应对使用的分子标记进行适当筛选,并尽量研究更多位点的变异以获得基因组遗传变易更全面的信息。本研究的结果可为进一步家兔的遗传变异及QTL定位提供分子基础数据。
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