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由尖孢镰刀菌（Fusarium oxysporum）引起的棉花枯萎病真菌性病害,是棉花种植期最常见的毁灭性病害。本研究选取20个对枯萎病抗性不同的海岛棉品种和20份06-146与新海14号杂交群体后代材料,采用人工接菌方式进行抗性鉴定和产量性状分析;采集棉花枯萎病病秆,分离筛选强致病菌株,以杂交群体母本抗黄萎病耐枯萎病品种新海14号为靶标材料,进行室内药剂毒力测定;同时,采集抗病棉花材料根围土壤,获得生防效果较好的拮抗细菌,为棉花抗病育种工作和病害防治提供理论基础和科学依据。结果表明:1.选取20个海岛棉品种及20份06-146与新海14号杂交群体后代材料,进行室内、田间抗性鉴定和产量性状分析。海岛棉抗病品种占比35%,包括海岛棉品种06-146、新海13号、新海20号、新海21号、新海29号、N9247和C06015;06-146与新海14号杂交群体后代抗病材料为65%,包括10702、10719、10724、10727、10749、10765、10787、10862、10876、10880、10889、10892和10902。通过产量性状分析可知,20个海岛棉品种相对病情指数与单株结铃数呈极显著负相关关系,相关系数为-0.672。20份06-146与新海14号杂交群体后代材料相对病情指数与单株结铃数呈极显著负相关关系,相关系数为-0.599;与单铃籽数和单铃总重的相关系数为-0.267和-0.265,呈现出显著负相关关系。2.通过分离纯化棉花枯萎病病原菌菌株,选取杀菌剂1000亿/g枯草芽孢杆菌可湿性粉剂、8%宁南霉素水剂、0.3%四霉素水剂和80%代森锰锌可湿性粉剂,分别对编号为DD64、DD89、DD11和DD22的强致病菌株进行室内药剂毒力测定。测定新疆北部地区分离出的DD64和DD89菌株,1000亿/g枯草芽孢杆菌可湿性粉剂抑菌率最高,分别为96.47%和95.29%,0.3%四霉素水剂次之。测定新疆南部地区分离出的DD11和DD22菌株,0.3%四霉素水剂抑菌效果最好,分别为97.91%和99.35%,其次是1000亿/g枯草芽孢杆菌可湿性粉剂。DD64和DD89经毒力测定,8%宁南霉素水剂毒力最强,EC50值为0.044 mg/L和0.046 mg/L。在生产上,0.3%四霉素水剂建议在病害发生初期使用以防止病害的扩展和蔓延,1000亿/g枯草芽孢杆菌可湿性粉剂和8%宁南霉素水剂可作为轮换药剂对该类病害进行有效防治。3.采用平板对峙法,以棉花枯萎病尖孢镰刀菌为靶标菌,从抗病材料土壤中分离到的120株细菌菌株中筛选拮抗菌株,促芽试验和盆栽试验显示,编号KX-33拮抗细菌能明显缩短出芽时间,促进棉苗生长,芽长、根长和芽鲜重分别为8.53 cm、5.40 cm和1.72 g。对病原菌DD64、DD89、DD11和DD22菌株防效分别为75.32%、72.77%、69.48%和68.81%,均显著高于其它药剂处理（P<0.05）。该拮抗菌株在盐碱环境下可正常生长,具一定耐盐碱性。结合菌株形态及生理生化特性、16S r DNA和序列分析显示,拮抗细菌菌株KX-33镜检为革兰氏阳性菌,呈杆状,有芽孢,与Bacillus pumilus（FJ763643.1）同源性最高。