microRNA (miRNA)是一类核苷酸序列长度约为22个的内源性非编码的RNA分子。自从它于1993年被正式发现以来,人们围绕着它业已展开了许多诸如功能作用,结构分析,序列预测和起源进化等多方面的研究工作。研究表明：微RNA对于后生生物(多细胞动物)的细胞的分化和形体发育形成等许多方面起着重要的作用。因此,微RNA的起源和进化很可能与身体结构的发育(body plans)如物种内的表型变异现象密切相关。揭示微RNA的起源和进化过程,不仅能解决这些微RNA何时出现并在物种中如何变化的问题,也能为其功能的研究提供了一定的理论基础。目前关于微RNA起源、进化的研究,通常采用两种类型的研究、分析方法。第一种是从分子生物学的角度,进行诸如序列比对、序列聚类分析和微RNA-转录因子-功能基因共进化分析来研究微RNA的起源和进化的问题。另一种方法是使用统计学方法,通过在不同物种中对微RNA的种类进行计数并比较相同的微RNA家族成员在不同的物种中分布的情况,研究人员可以推测某些微RNA或微RNA家族的起源和进化历史。这些研究方法基本都依赖数据挖掘工作,数据的完整性对这些针对微RNA起源、进化的研究工作影响是比较大的。于是我们考虑从生物发生律的角度对微RNA的起源进行研究。生物发生律,也被称为生物重演律,指的是后生生物从胚胎发育到成熟个体的过程,是从原始的单细胞动物进化到其生物学界元的简单而快速的重演。更简单地说,这种理论是基于两个重要的概念：1,生物有相同的起源和共同的祖先；2,一般而言,较高级的生物从他们的较原始的祖先那里获取了遗传并进一步出现了变异和发展。微RNA,作为后生生物体内的一个“微观管理者(micro-manager)",在不同的组织和器官的发生发育过程中扮演着非常重要的角色。因此,我们认为某些miRNA家族的起源可能与组织和器官的产生与进化密切相关,即：微RNA家族的起源和进化遵循生物重演律。我们对人类微RNA表达谱数据进行计算,鉴定出了5个组织、器官特异性的微RNA家族(胎盘特异性微RNA家族：miR-515家族,附睾特异性微RNA家族：miR-743家族和miR-891家族,肝脏特异性家族：miR-122家族以及睾丸特异性家族：miR212家族)和19个胚层特异性家族(2个内胚层特异性微RNA家族：miR-192家族和miR-217家族；7个中胚层特异性微RNA家族：miR-155家族,miR-187家族,miR-196家族,miR-205家族,miR-208家族,miR-449家族和miR-449家族以及10个外胚层特异性微RNA家族：miR-124家族,miR-128家族,miR-137家族,miR-219家族,miR-330家族,miR-454家族,miR-488家族,miR-542家族,miR-628家族和miR-9家族)；然后就其特定的组织、器官和三胚层的起源时间确认了这些微RNA家族的较为具体的起源时间并结合了鉴定出的非组织特异性微RNA家族在数据库中分布的最古老物种所追溯的起源时间一起构建出了部分微RNA家族的起源图谱。本研究通过采用较为新颖独到的视角解决了一些微RNA家族的起源时间和进化分析上的问题,并且也可以为针对相关微RNA家族的具体研究提供一些有益的帮助。