Bacillus subtilis芽胞及Argonaute系统用于环境污染物检测的研究

来源 :华中农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yaoyaoyy1188
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
生物材料、生物技术地开发在环境治理、临床诊断及工业生产中具有十分重要的意义。本研究开发了一系列基于Bacillus subtilis(B.subtilis)芽胞、Pyrococcus furiosus Argonaute(PfAgo)系统的生物传感方法和技术并用于环境污染物检测。主要研究内容如下:一、建立了芽胞/鲁米诺化学发光体系与草甘膦氧化酶降解体系相结合的新型草甘膦检测方法。首先,甘氨酸氧化酶能够降解甘氨酸,同时具有微弱的草甘膦降解活性。本工作以Bacilluscereus甘氨酸氧化酶作为原始材料,通过定向进化技术获得特异性降解草甘膦产生H2O2的氧化酶B5R18。相比于原始甘氨酸氧化酶,B5R18对草甘膦的催化效率、特异性常数、亲和增强因子分别提高了 2.85×103倍、2.25×105倍、9.64×104倍。然后,发现B.subtilis芽胞CotA-laccase能够催化鲁米诺/H2O2体系产生化学发光信号。该方法实现了对H2O2检测,检测限为0.050 μmol L-1(S/N=3),检测范围为0.050-20 μmol L-1(R2=0.99)。最后,结合上述研究,提出了基于B.subtilis芽胞的化学发光体系用于草甘膦检测,检测限为0.090 mg L-1(S/N=3),检测范围为0.090-75 mg L-1(R2=0.99)。本方法具有特异性高、成本低、操作简单及环境友好的特点,具有良好的实际应用价值。二、建立了基于芽胞/3,3’,5,5’-tetramethylbenzidine(TMB)的F-检测方法。首先,发现F-对芽胞CotA-laccase的催化活性具有强抑制作用。由此,本工作开发了基于芽胞/TMB的可持式试剂盒用于F-定量和半定量检测。通过简单操作,本方法实现了对F-的高灵敏检测,检测限为0.90 μmol L-1(3σ),检测范围为5-600 μmol L-1(R2=0.99)。本方法具有成本低、灵敏度高、特异性强、操作简单的优点,成功应用于地表水、地下水中F-浓度检测。最后,使用溶液酶法、光谱法等方法对芽胞CotA-laccase的F-抑制机理进行研究,得出F-通过与CotA-laccase T2 Cu位点结合,抑制了电子在三铜核心中(TNC)T2 Cu与T3 Cu的电子传递,最终抑制CotA-laccase还原态与氧化态之间的转化过程。三、建立了基于芽胞/2,2’-azinobis(3-ethylbenzothiazoline)-6-sulfonic acid(ABTS)/o-dianisidine dihydrochloride(o-dianisidine)体系的 pH 检测方法。首先,发现芽胞 CotA-laccase在酸性、中性、弱碱性条件下均表现出催化活性,并且具有pH敏感性。通过添加复合底物ABTS/o-dianisidine,本方法实现了对pH 1.00-9.00地检测,并成功应用于地表水、土壤样品中的pH分析。此外,本方法还用于评估生肉的新鲜程度。最后,通过溶液酶法、光谱法等方法的研究分析,得出OH-通过同时与芽胞CotA-laccase的T1、T2 Cu位点结合,影响了酶的电子传递过程,引起芽胞CotA-laccase催化活性地变化。四、拟建立基于PfAgo的Hg2+检测平台。本工作率先提出将Ago系统应用于环境污染物检测。通过Aptamer识别、链置换恒温扩增、PfAgo的目的核酸识别过程,拟对Hg2+进行特异性检测。目前,正在对实验的可行性进行分析,下一步将对检测限、检测范围等进行深入研究。
其他文献
目前的研究显示硬骨鱼类的干扰素(interferon,IFN)包括Ⅰ型、Ⅱ型和Ⅳ型IFN,其中Ⅰ型IFN可分为三组(group),并进一步分为七个亚组(subgroup),IFNa、IFNd、IFNe和IFNh为第一组,IFNb和IFNc为第二组,IFNf为第三组,而鱼类的Ⅱ型IFN则有两个成员,IFN-γ和IFN-γrel。本研究在乌鳢中鉴定了 4个Ⅰ型IFN基因,分别为IFNc、IFNd1、I
学位
硬骨鱼类作为终身生活在水体中较为原始的脊椎动物,在数以亿年计的时间里逐渐演化出一套完整有效的免疫系统来防御不同水生病原的入侵。B细胞作为硬骨鱼类获得性免疫中的主要效应细胞,其分泌的抗体可以靶向病原分子来促进机体对病原菌的清除。然而,现有研究主要将硬骨鱼类B细胞作为抗体分泌细胞(antibody-secreting cell,ASC)这一整体类型,很少深入研究硬骨鱼类B细胞不同亚群的表型和功能,而对
学位
基于光催化的高级氧化技术可以直接利用太阳光的能量,诱导产生种类众多、数量庞大的活性氧物种(ROS)参与有机污染物降解,被认为是环境污染控制和食品安全保障方面极具潜力的技术手段之一。实现ROS的光化学诱导增强和精准调控对促进有机污染物的高效降解意义重大。虽然众多研究者在ROS光催化调控和相关机理研究方面做出了大量的工作,但目前ROS光催化产生效率依然有待提高。此外,光催化诱导ROS的产生往往是多途径
学位
近年来研究发现,母本染色质和父本染色质在某些基因组位置上表现出差异,然而这种结构上的等位效应与等位基因表达之间的关系尚不明确。将体细胞核移入去核卵母细胞,体细胞经过重编程(Reprogramming)恢复到全能性状态,并且最终发育为新个体的技术称为体细胞核移植技术(Somatic Cell Nuclear Transfer,SCNT)。然而在体细胞核移植重编程中染色质高阶结构及其等位效应所发挥的作
学位
真核生物染色质的转录与复制需要特定的顺式调控元件与反式作用因子的组合调控。同时,反式作用因子只能结合在染色质折叠程度低的、无核小体区域,这部分区域被称为染色质开放区域(open chromatin region,简称OCR)或者染色质可及性区域(chromatin accessible region)。作为一个富含调控元件的重要结构特征,OCR对于理解基因组的转录调控机制具有重要的研究意义。近些年
学位
豆科植物(legumes)能够与根瘤菌(rhizobia)特异性识别形成根瘤(nodule),在这一过程中,植物为根瘤菌提供所需的营养物质,而根瘤菌则发挥其固氮功能将大气中的氮气(N2)转换成氨(NH3),供给植物生长利用,二者互利共生。共生固氮(symbiotic nitrogen fixation)被视为是目前最环保且高效的固氮方式之一,全球生物固氮总量的60%以上来源于共生固氮。因此,通过研
学位
植物分生组织是一组具有自我更新能力的功能干细胞,并且能够以特定的模式产生侧生器官。分生组织的特性(identity)和确定性(determinacy)对植株的形态建成和花器官发育至关重要。本课题组鉴定到一个玉米MADS-box家族基因ZmMADS8,通过转基因家系创制及其遗传分析和表型鉴定,旨在解析ZmMADS8在玉米花序形态建成、小花发育、籽粒蛋白和淀粉合成中的生物功能与调控途径,为该基因的育种
学位
DNA的胞嘧啶-磷酸-鸟嘌呤(CpG)位点的甲基化与基因表达调控、细胞通路激活、个体发育、疾病进展有密切的关系。如何对大量的CpG甲基化位点进行分析、建立可信DNA甲基化与细胞调控关系等问题仍堪待解决。临近的DNA甲基化CpG位点通常具有一定的相关性,并可以藉此形成一个大的DNA甲基化相关性区块(methylation correlated block,MCB)。MCB可用于泛癌数据的分类建模,但
学位
热应激是影响畜牧业生产力最常见的应激源之一。近年来,热应激对动物生殖功能的影响受到广泛关注。研究表明,热应激影响机体激素分泌、生殖细胞增殖和胚胎发育过程从而降低母猪的繁殖性能。目前,国内外热应激对母猪繁殖性能的相关研究主要集中在卵巢功能和胚胎发育上,热应激是否影响猪胚胎附植早期子宫的相关机制方面的研究较少。研究表明热应激通过改变细胞完整性引起高渗应激,导致细胞内环境的改变。在胚胎附植期间,子宫内环
学位
甘蓝型油菜是我国重要的油料作物之一,种植面积常年稳居世界第一,菜籽油是我国传统的食用油,占国产食用植物油总量的50%以上。油菜是在约7,500年前由白菜和甘蓝自然杂交形成的异源四倍体物种。由于基因组间频繁的交流以及染色体加倍后的冗余基因丢失、亚功能化等,油菜的基因组内序列和基因的表达均积累了大量变异进而影响油菜表型。随着测序技术的发展,油菜研究领域已经积累了大量的基因组和转录组测序数据,并鉴定到影
学位