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人类主要组织相容性抗原系统(Major Histocompatibility Complex,MHC)即人类白细胞抗原系统(Human Leucocyte Antigen,HLA)位于人类第6号染色体的短臂(6p21.3),是人类基因组已知编码区中多态性最高、基因最复杂的遗传系统,其编码的细胞表面糖蛋白分子在机体的免疫识别、器官及骨髓移植、疾病相关性等医学研究方面以及在探讨人类起源、迁移和不同群体的遗传关系等人类学研究方面都有着重要的意义。本文首先对HLA-DQB1基因的PCR-SBT分型方法进行了改进研究,然后应用该方法对云南彝族进行了HLA-DQB1基因多态性研究。同时,把彝族和世界其他人群进行了HLA-DQB1基因频率的比较和聚类分析。在国际组织相容性工作组(International Histocompatibility Working Group,IHWG)推荐的HLA-DQB1基因PCR-SBT方法的基础上,我们在HLA-DQB1基因的第二外显子的两侧的内含子内设计了一对外引物,将原方法改进为巢式PCR-SBT方法,并将测序引物选取在远离第二外显子5′端上游约190bp处。这样既提高了分型的灵敏性,节约了样品DNA用量,也大大增加了所测序列5′端的可读性。同时实践表明,借助于自动分型软件(AGP),我们改进的HLA-DQB1基因分型方法是目前精确度最高、分辨率最强的自动基因分型方法之一。我们应用该方法对云南68例彝族样本进行了HLA-DQB1基因分型研究,共准确地检测到13种等位基因,分别为DQB1*03011和DQB1*0309都是21.01%;DQB1*0401占8.7%、DQB1*0402占8.7%;DQB1*0201和DQB1*0202各占7.97%;DQB1*0302和DQB1*03032各占7.25%;DQB1*0203、DQB1*030202和DQB1*030202各占1.45%。Hardy-Weinberg平衡检测表明,彝族人群中,杂合子频率的观察值普遍小于期望值。这暗示了在彝族人群中可能存在某些隔离机制导致了基因在人群中非随机地遗传,如近亲繁殖或地理上的隔离造成。彝族群体HLA-DQB1基因的Evens-Watterson中性选择检测结果显示HLA-DQB1基因是遵循中性选择模式进化的。通过中华民族12个人群的HLA-DQB1等位基因频率的比较分析表明,在南北人群中HLA-DQB1等位基因频率的分布具有一定的规律性,这提示我国人群可以划分为南北两大类群。同时,以世界35个人群的HLA-DQB1等位基因频率为基础构建的系统树支持了我国人群可分为南方和北方两大类群的观点。