玉米是生产上最早利用杂种优势的作物,在杂交种选育过程中,配合力和遗传差异是亲本选配的重要依据。研究不同世代株系遗传变异和配合力效应,并明确其世代间的变化规律,对提高玉米育种效率具有重要意义。本研究以优良杂交种DK008F₂群体选育的50个S₄和42个S₆代株系为材料,利用SSR标记研究遗传变异;以2个玉米骨干自交系为测验种,通过不完全双列杂交设计,分析不同世代株系的配合力、组合杂种优势及其相关性,为玉米自交系及杂交种的选育提供理论依据。主要研究结果如下:1.SSR-PCR扩增结果,40对SSR引物在50个S₄和42个S₆代株系中分别检测到68和65个基因型,以及72和77个等位基因。按类平均法（UPGMA）进行聚类分析,以遗传相似系数0.89为阈值,将S₄和S₆代株系及测验种分别划分为7个和5个类群,聚类结果与系谱来源基本一致。2.遗传变异分析表明,相同S₂来源的S₄代株系间或同一S₄衍生的S₆代株系间的SSR遗传距离及差异位点数均小于不同来源的株系;多数S₆代株系内株高及穗位高变异系数低于S₄代;差异位点数为“1”的S₄株系占S₄株系总数的8%,而差异位点数为“1”或“0”的S₆代株系占株系总数的61.9%。说明随着世代的增加,株系间的遗传差异逐渐变小,从S₄代株系开始逐渐纯合,多数S₆代株系可能趋于纯合。因此,在S₂代应多选择优良单株自交,以保持群体的遗传多样性,S₄代之后可逐步减少株系中的单株选择数量。3.配合力方差分析表明,在S₄及S₆代株系中,产量等12个和11个性状GCA分别达显著差异;产量等8个和6个性状SCA差异分别达显著水平;株高、穗长和产量等性状GCA或SCA与地点互作显著。综合2试点结果,来自D15的S₄及来自D1520和D1528的S₆代株系产量GCA正效应较高;除D1540的S₆代衍生系与K305杂交组合产量SCA小于D1207外,其余D15衍生的S₄及S₆代株系与2个测验种的组合产量SCA平均值及正效应比例均大于来自D12衍生系。可见,育种上用相同测验种通过连续早、中代配合力测定,可以实现自交系与杂交种的同步定向选育,从而提高育种效率。4.两个试点杂种优势分析结果,来自D15的S₄代组合产量杂种优势较高,而D12衍生的S₄代组合相对较低;除D1540外,其余D15衍生的S₆株系与同一测验种组配的组合平均产量优势和正向优势比例均高于D12衍生的S₆代株系。本研究育成3个S₆代组合K305×D152824、K305×D152823及K365×D152031,分别比成单30增产21.26%、21.74%和24%,已进入省级新品种筛选试验。证明杂种优势在世代间表现相对一致性,因此在自交分离世代提早选择优良株系组配是有效的,对加快杂交种的育种进程具有重要意义。5.相关性分析表明,除K305与S₆代株系间的SSR遗传距离与产量SCA和产量杂种优势分别呈显著负相关外,其余株系与2个测验种间的这些相关性均不显著;不同测验种与S₄及S₆代株系配制的组合,其产量杂种优势与产量GCA、SCA和TCA间的相关系数均达显著水平。可见,亲本间SSR遗传距离不足以预测产量杂种优势和产量SCA,而在分离世代选择高GCA株系,可望组配选育出高SCA的强优势杂交组合。