雌激素（17β-estradiol,E2）水平的紊乱诱导雌激素靶基因的异常激活是导致雌激素受体α（estrogen receptor alpha,ERα）阳性乳腺癌的一个重要因素,然而雌激素靶基因的转录激活机制目前尚未完全阐明。尽管表观遗传调控元件超级增强子（super enhancer,SE）在基因转录调控中发挥关键作用,但在ERα阳性乳腺癌中的超级增强子调控基因转录的分子机制目前还缺乏系统性认知。我们重点研究ERα阳性乳腺癌细胞基因组中超级增强子如何招募表观遗传调控子及辅因子协同ERα共同激活超级增强子,从而导致与癌症发生发展密切相关的靶基因的转录激活。本论文主要从高通量测序数据的生物信息分析角度探讨了溴结构域蛋白4（bromodomain containing 4,BRD4）和 JmjC 结构域蛋白 6（JmjC domain-containing protein 6,JMJD6）被ERα结合的超级增强子招募,是E2/ERα诱导的超级增强子激活和靶基因转录的关键调节方式。BRD4和JMJD6在ERα结合的超级增强子上的结合负责调控RNA聚合酶Ⅱ（RNA polymerase Ⅱ,Pol Ⅱ）的募集和超级增强子RNA（enhancer RNAs,eRNAs）的产生,进而导致超级增强子相关的雌激素靶基因的转录激活。通过质谱和生物信息结合分析发现JMJD6与中介体复合物（Mediator complex）中的中介体复合物亚基 12（mediator complex subunit 12,MED12）直接相互作用从而将MED12招募至超级增强子处。出乎意料的是,JMJD6调节MED12与共激活因子相关的精氨酸甲基转移酶1（coactivator associated arginine methyltransferase 1,CARM1）的结合,CARM1 能够甲基化MED12的多个精氨酸位点并调节其染色质结合。与其在转录激活中的关键作用一致,BRD4和JMJD6是E2/ERα诱导的乳腺癌细胞生长和肿瘤发生所必需的。我们的数据揭示了在E2/ERα诱导的超级增强子、超级增强子相关的基因激活以及乳腺癌细胞生长方面发挥重要作用的若干关键调节因子,为ERα阳性乳腺癌提供了可靠的治疗靶标。