云南粉虱传双生病毒的检测及遗传多样性分析

来源 :云南大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:chenjun7575
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
粉虱传双生病毒(Whitefly-transmitted geminivirus,WTGs)是一类单链环状DNA植物病毒。WTGs寄主范围广,重组变异快,严重威胁着全球热带、亚热带地区农作物。我国南方省份都相继检测到该类病毒,并且其危害有日益加重的趋势。本文对采自云南各地不同时期,不同寄主上WTGs的发生、分布及其遗传多样性进行了分析,并建立了农杆菌介导的侵染性克隆体系。 用双生病毒简并引物PA和PB对各地采集的样品进行了PCR检测,共有47个样品扩增出约500 bp的目的条带。克隆测序后发现,这些样品中均检测到WrGs,且初步确定为9种不同病毒。在此基础上进一步扩增并克隆、测定了37个分离物DNA-A全序列,序列分析表明云南WTOs具有丰富的种类多样性,它们分属于11种病毒,而中国番茄黄化曲叶病毒是云南WTGs的优势种。 对其中15个中国番茄黄化曲叶病毒分离物进行了种内遗传多样性分析,它们之间的同源性在88.7%~99.9%之间。基于DNA-A核苷酸全序列和病毒外壳蛋白氨基酸序列构建的系统进化分析表明,该病毒具有明显的地理分布差异,外壳蛋白的系统进化结构还表现出寄主差异。 对这11种病毒共37个分离物进行种间的多样性分析。分别构建了DNA-A全序列、外壳蛋白和复制相关蛋白的系统进化树。三者的系统进化结构不一致,推测是病毒的不同编码框,所受选择压力不同,导致不同的变异及种闻的重组。从地理区域的差异看,丽江和大理的病毒种类单一且亲缘关系较近;楚雄病毒种类多,以TYLCCNV为优势种;德宏的病毒种类上与其它地区存在较大差异,且表现出明显的寄主相关性,其中甘薯曲叶病毒属于新世界双生病毒。 在红河地区分离到云南辣椒曲叶病毒,并从1个辣椒样品、3番茄样品克隆了该病毒的全长序列。序列比对表明,他们之间的同源性在99.3%以上,但与中国番茄黄化曲叶病毒同源性最高,仅为87.3%,根据双生病毒划分标准,属于菜豆金色黄花叶病毒属的一个新种。 构建了野茼蒿黄脉病毒DNA-A的侵染性克隆。DNA-A单独接种以及DNA-A和赛葵黄脉病毒卫星分子DNA β混合接种均可系统侵染心叶烟、普通烟和番茄,并诱导产生黄化、卷曲等典型症状。
其他文献
天然林是自然界中群落最稳定、生物多样性最丰富、结构最复杂的陆地生态系统,在维护区域生态平衡、应对气候变化、保护生物多样性等方面发挥着不可替代的重要作用。随着国际社
基因的表达调控在很大程度上由各类转录因子介导。转录因子Ets1是ETS蛋白家族的基本成员,可以以反式作用元件形式行使功能或与其它转录因子结合形成调控复合体发挥转录激活或
宽带综合业务数字网(B-ISDN)具有传统的通信网不可比拟的优势.B-ISDN具有业务独立性,其核心是异步传送方式(ATM).因为任何通信网都必须具有交揣功能,对于B-ISDN需要实现ATM交
随着信息和通信技术的飞速发展,声码器成为数字通信系统的重要组成部分,在军事通信、移动通信和互连网的快速发展下,带宽资源变得非常有价值,因此低速率语音编码技术近年来成
该文对腔体结构电磁散射分析中常用的模式法、弹跳射线法、复射线法等进行了对比探讨,利用用模式选择法对传统的模式法进行了改进,并计算了体的散射,克服了腔体传播模式法进
随着现代电子战信号环境的日益恶化,利用无源接收天线阵列收集敌方辐射源信息,进行阵列信号的多维参数提取(即多参量联合估计)工作已变得越来越重要也越来越困难。尤其是当入射
该文首先基于卡胡南-洛级数从最大后验概率准则入手导出了最大似然函数.然后,分析了基于似然数最大化的最佳检测器的工作原理,分析表明最佳检测方案可权看作一个有约束的优化
该文在介绍开关电源工作原理的基础上,讨论了设计开关电源的拓扑结构的关键性问题及其处理方法,同时考虑了噪声对输出电压的影响以及同步整流管的功能.该文的重点是设计一个
该文根据导师的有关基本思想,提出根据其相空间结构来刻划混沌吸引子的方法.该文的主要工作是通过计算机数值仿真对三阶混沌吸引子的周期轨道的统计特性进行分析,确定每类周
该论文涉及的空中编程遥测数据采集系统是目前国内功能最全,性能最优良的空载测试设备.数据采集系统采用微处理器(TMS320C25)控制,它的全部工作在微处理器的程序控制下进行,