随着高等教育体制改革的不断深化，高等学校办学经费来源多元化，很多高校普遍存在会计信息失真、国有资产流失、财务收支混乱、“小金库”现象等问题，为规范会计行为、强化会计监督、根治会计信息失真，从改革会计人员管理体制着手，在高校内部实行会计委派制是相当必要的。实行会计委派制改善了会计人员依法进行核算和监督的环境，使之不依附于所在单位，独立行使财务监督权。高校实行会计委派制度，对于解决高校财力分散、财经纪律松弛、资产管理混乱、私设小金库等问题都起到积极作用。实行会计委派制加强了学校的财务管理，规范了内部工作秩序，提高了会计核算质量。　　本文对会计委派制产生的背景和会计委派制的理论依据-委托代理理论进行了介绍，对比分析了武汉大学、清华大学、中国农业大学三所高校实行会计委派制的效果。并以北京大学为研究对象，实证分析了高校会计委派制中存在学校、委派会计和二级单位三者之间利益冲突问题，并提出相应的解决对策和完善高校会计委派制的各项措施。