犬源奇异变形杆菌分离鉴定与多重耐药株基因组序列分析

来源 :吉林农业大学 | 被引量 : 3次 | 上传用户:pankun001
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奇异变形杆菌是重要的人畜共患病原菌,该菌在人医临床已被认为是仅次于肠道致病性大肠杆菌的人畜共患菌,且该菌引发疾病的发病率和死亡率呈逐年递增趋势,引起了国内外相关学者的高度关注,该菌能够引起腹泻、肾结石、结膜炎、克罗恩等多种疾病。临床上通常用抗生素对该菌引发的疾病进行治疗,但由于抗生素的长期不合理使用,已促使奇异变形杆菌高度耐药株的产生,不但给该菌引发疾病的治疗增加了困难,同时其耐药基因和可移动原件在细菌之间的水平传播,给人和动物的公共卫生安全造成了严重的威胁。为此,亟需对具有高度耐药性和致病性的奇异变形杆菌展开耐药基因环境的研究,以期为其耐药机制的研究提供科学依据和理论基础。本研究拟对长春地区2015—2017年送检的疑似细菌性肠炎的犬腹泻样本进行奇异变形杆菌的分离鉴定,筛选出具有高度耐药性和致病性的菌株,进一步对其开展全基因组和质粒的序列测定,分析其耐药基因环境。主要研究内容如下:1.奇异变形杆菌分离鉴定与生物学特性分析从62份犬腹泻样本中共分离获得12株奇异变形杆菌,分离菌对兽医临床常用药物耐药水平较高,仅有部分菌株对环丙沙星、恩诺沙星、头孢曲松较敏感。其中分离菌CC15031株不但对磺胺间甲氧嘧啶、氟苯尼考、强力霉素、头孢曲松、克林霉素、环丙沙星、恩诺沙星、红霉素、氯霉素、庆大霉素等十种受试抗生素全部耐药,其致病性也较强(LD50=2.8×106 cfu/mL)。2.CC1503株全基因组序列分析本研究采用二代测序-三代测序方法对具有较高致病性和耐药性的奇异变形杆菌CC15031株进行了全基因组序列分析,CC15031全长4,031,742 bp,GC含量为38.99%,共有3745个基因,其基因组上携带18个耐药基因(可分别介导对青霉素类、头孢菌素类、大环内酯类、氨基糖苷类、四环素类、磺胺类药物耐药),同时该菌还携带15个基因岛(其中基因岛GIs012携带8个耐药基因)、6个T3SS分泌系统以及未知功能的非编码区序列。此外,该菌基因组含有包括溶血素Hyla、菌毛操纵子mrp J等363个毒力因子。3.CC15031株质粒序列分析与功能初步研究本研究对具有多重耐药性的致病菌CC15031株进行质粒序列分析,其质粒全长为261,999bp,GC含量为49.9%,包括509个基因,七个tRNA和一个rRNA,包括blaCTX-M、blaTEM-1、mpha、tetc、sul2、ermb、macb、vansb等十七个耐药基因(可介导对头孢菌素、磺胺类、万古霉素等抗生素耐药)。对质粒进行接合转移实验,质粒在4h即可发生转移到受体菌中,并赋予接合子对头孢呋辛、头孢吡肟、氯霉素、磺胺间甲氧嘧啶、红霉素、克林霉素、强力霉素、克林霉素、庆大霉素等九种抗生素产生耐药性。
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