以福建省龙岩武平,云南,四川所采集的共109个野外香菇菌株为群体,应用RAPD,SRAP,SCAR分子标记扩增对产生的扩增片段用DPS,NTSYS等相关软件进行分析,聚类,结合出菇试验对野生资源进行评价。聚类结果显示供试菌株相异系数范围0.0252-0.9630,个别菌株间有较大差异,群体平均相异系数为0.4348。地理主座标分子分析结果显示:供试菌株大体上可以按照中国东部(福建龙岩)和西部(云南、四川)分成2类,说明了资源分布有一定的区域性,而主栽品种则基本上游离于野外采集的菌株群体之外。通过对农艺性状进行主成分分析,结果显示:第1主成分为朵型产量构成因子,贡献率达72.93%;第2主成分为生长速度构成因子,贡献率为15.02%,两个主成分累计贡献率为87.94%。兼顾两个主成分,筛选出亲缘关系较远,产量高,朵型以及转色好的L0212和生长速度快的L0249作为杂交亲本。对配对过程中有产生锁状联合的杂交菌株进行出菇试验,最终筛选到一株菌丝生长速度快、转色良好、产量高、朵型好的优良菌株L0249XL0212Y,其产量超过主栽品种L0071(939)32%,并对该杂交菌株进行了拮抗,分子的验证。