Hepcidin基因在南极鱼类中的适应性进化和分子功能的初步研究

来源 :中国科学院遗传与发育生物学研究所 | 被引量 : 0次 | 上传用户:a395744775
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
Hepcidin是一种富含半胱氨酸的小分子抗菌肽,在生物体内起着抗菌和调节铁离子代谢的双重功能。研究发现在低等脊椎动物体内存在很多hepcidin的同源体,它们有着相似的结构,成熟的hepcidin由20~25个氨基酸组成,分子内有8个高度保守的半胱氨酸残基相互配对形成了4对二硫键。在硬骨鱼中,hepcidin具有很高的多样性,这可能与其生活的复杂多变的水环境有关。南极水域是地球上温度最低、氧含量最为丰富的水域,常年生活在南极水域里的南极鱼针对这一极端的环境做出了一系列的适应性进化,这里我们主要研究了南极鱼notothenioid的hepcidin基因的多样性,及其对寒冷环境的适应性进化,并对其功能进行了初步的研究。南极鱼notothenioid的hepcidin至少有4种不同的突变体(variants),形成了两种截然不同的结构类型,第一类hepcidin,为了方便我们称之为8cys_hepcidin由3种不同的突变体组成,他们与以往发现的hepcidin一样都有着8个半胱氨酸残基的相似组成,而第二类的hepcidin,我们称之为4cys_hepcidin,则与以往已知的hepcidin都不同,仅仅含有4个半胱氨酸残基,这4个半胱氨酸残基两两配对,形成2对分子内二硫键,通过dN/ds比值的分析和基于site-specific模型的似然比值检验(Likelihood Ratio Test)发现南极鱼notothenioid成熟的hepcidin编码区有显著的正选择,表明南极鱼hepcidin基因表现出了对环境的适应性进化。利用基因组PCR和Southern杂交鉴定发现4cys hepcidin只特异的存在于南极鱼中,而在非南极鱼(non-Antarctic taxa)中则没有发现,表明了这种分子内半胱氨酸残基数目的减少是对南极极端环境的一种适应机制。另外我们在另一种生活于南极水域的eelpout中也发现了一种含有4个半胱氨酸残基的hepcidin,而eelpout和南极鱼notothenioid在分类学上分属于不同亚目,是一类相差较远的物种,利用Neighbor-Joining方法建树分析发现eelpout的hepcidin虽然同样仅含有4个半胱氨酸残基,但和notothenioid的4cys hepcidin有着不同的起源,这也进一步说明了hepcidin中半胱氨酸残基数目的减少确实是对寒冷环境的一种适应性进化。
其他文献
伴随着物联网概念的广泛普及,无线传感网络在工业和生活中的应用爆炸式增长,传感器作为感知世界各种信息的工具必不可少。根据特定的应用,传感器有不同的分类,相应的也可以感知不
基于布里渊散射的全分布式光纤传感系统具有对光纤中应变和温度长距离连续分布式测量的能力,可应用于大型建筑、公路、隧道、桥梁、大坝、通信光缆、油气管道等的健康状况监
有机电致发光显示(Organic Electron Luminescence display)技术被誉为具有梦幻般显示特征的平面显示技术,因其发光机理与发光二极管(LED)相似,所以又称之为OLED(Organic Light
学位
光谱阶跃式集成滤光片作为一种精细分色元件,在多光谱航天遥感仪器中可以发挥重要的作用。本文紧密围绕项目对集成滤光片的技术要求,结合集成滤光片国内外的发展现状,展开了对多
学位
生态系统为人类提供低熵物质和能量的能力是有限的。因此,如果没有节约型的生产过程和消费模式,一个有限的环境不可能支撑无限的增长。环境中的低熵比李嘉图的土地更为稀缺,
本研究围绕斑衣蜡蝉(Lycorma delicatula)的跳跃行为,进行了生物学、形态学、运动学和行为学的一系列实验。本研究通过对斑衣蜡蝉的生物学研究,既发现了斑衣蜡蝉跳跃行为依据其后
本论文主要涵盖了三方面的工作,可分为五部分。第一部分介绍了量子点的基本特性和应用进展。在第二部分,利用短程VFF方法,我们讨论了应力在量子点形成过程中对单个量子点形状及
学位
香溪河是长江三峡水库湖北省库区内最大的支流,在对香溪河流域底栖藻类长期监测的基础上,研究了流域主要人类活动对底栖藻类的影响,包括:1)香溪河底栖藻类群落动态;2)流域土地利用
能值分析和生态足迹是两种量化研究生态经济系统的理论体系,它们的运用目前非常广泛。互花米草在苏北海滨湿地的扩张也引起人们对其机理和控制的研究热情。   本文总体上可
In this article, using the likelihood score theory extended to nuisance parameters we derive a new homogeneity score test for comparing linage disequilibrium ac