本文对水稻和拟南芥基因组中LRR-RLK基因家族进化模式进行了比较研究。在植物基因组中，富亮氨酸受体激酶(RLK)家族是RLK/Pelle基因家族中的一大亚族。在拟南芥基因组中有超过200个基因，其中大约有10个基因的功能已经了解。为了进一步了解这类家族在水稻和拟南芥中不同进化过程，在水稻和拟南芥中分别确定了314个和220个LRR—RLK类型基因。系统发生学研究表明534个基因分为45个不同的分支：有趣的是最大的分支包括92个水稻基因和6个拟南芥基因，这表明在水稻和拟南芥分化后这支基因在水稻中发生过大的扩张；第二和第三大分支中所包含的分别来自水稻和拟南芥的基因在数量上也存在很大差异，显示出在两物种中都发生过数量的扩张，较为特殊的是，第三大分支又分成两小簇，分别表现出单物种扩张的特征：其他的42支分别包括183个水稻基因和163个拟南芥基因，从数量和拓扑结构上未发生明显的扩张。因此得出结论LRR—RLK基因家族在两物种分化后经历了不同的进化过程。对重复基因的物理位置分析结果表明串联复制是LRR—RLK基因家族扩张的主要机制。进一步计算水稻LRR—RLK最大分支中基因的Ks、pi和dA值，结果显示：大约在46-107MY之前，水稻这一支的LRR—RLK基因发生过一次大的扩张事件，而且差异被固定下来。根据已知功能基因在进化树上的分布以及与NBS—LRR抗病基因家族和三个管家基因家族(housekeeping gene)的比较推断：LRR—RLK基因的不同进化模式源于其在物种分化后所承担的不同的功能。