动脉粥样硬化病人血清差异miRNAs及其靶基因分析

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[目的]动脉粥样硬化(AS)早期阶段不容易发现,难以早期诊断,如何及早发现和预防AS是一个新兴研究热点。本研究通过采用第二代测序技术,获得AS与健康人外周血血清的miRNAs差异表达谱,从中找出差异显著的miRNA分子;研究差异表达的miRNA在AS早期诊断中的作用;并通过生物信息学方法,分析其调控的靶基因,阐明血清的miRNAs在AS诊断中的作用。[方法]首先收集20例AS患者和20例健康成年人外周血标本,其中随机选出3例AS患者及3例健康人外周血提取总RNA,检测miRNA差异表达水平,采用第二代测序技术获得AS患者血清差异miRNA表达谱;选取其中3个miRNA分子通过RT-qPCR方法进行验证;生物信息学方法分析验证后miRNA所调控的靶基因,采用信号通路分析,揭示其在AS发生发展中的作用。[结果]1.AS患者和健康人在年龄,性别组成方面经方差分析,差异无显著性意义(p>0.05);AS患者的体重指数高于正常体检者,说明AS有肥胖的趋势;AS患者血总胆固醇、低密度脂蛋白(LDL)、甘油三酯水平均高于健康人(p<0.05),而高密度脂蛋白(HDL)水平低于健康人(p<0.05)。2.miRNA差异表达谱获得:通过二代测序,检测AS与健康人血清的差异miRNA表达谱,结果发现:两者之间有显著差异的有35个,其中AS上调的有21个,下调的有14个。3.实时荧光定量PCR对差异表达谱的验证结果:选取1个上调变化最大的miR-221-3p和2个下调变化最大的miR-126-5p、miR-143-3p,检测AS患者和健康成年人血清中的表达情况,结果证实miRNA基因上调的趋势与测序结果一致。4.miR-126-5p调控的靶基因,通过3个软件交集的基因有114个;涉及的信号通路合计106条,有3个以上基因共同涉及到2条KEGG信号通路,其中Hippo信号通路与AS关系密切。5.miR-143-3p调控的靶基因,通过3个软件交集的基因有37个;涉及的信号通路合计35条;2个以上基因共同涉及到5条KEGG信号通路,其中三条信号通路与AS关系密切:甘油磷脂代谢;MAPK信号通路;Ras信号通路。6.miR-221-3p调控的靶基因,通过3个软件交集的基因有42个;涉及的信号通路合计85条,3个以上基因共同涉及到4条KEGG信号通路,其中两条信号通路与AS关系密切:非酒精性脂肪肝;MAPK信号通路。[结论]1.获得了AS相关的血清miRNA差异表达谱。2.3个miRNA(miR-126-5p、miR-143-3p、miR-221-3p)有可能成为AS的潜在诊断标志物。3.3个miRNA(miR-126-5p、miR-143-3p、miR-221-3p)可分别调控相关信号通路,与AS的发生发展密切相关。
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