1998年正式实施《村委会组织法》以来，基层民主自治进程大大加快，同时由于中国经济发展不平衡，在经济欠发达地区如何有效发挥农村基层党组织的领导核心作用成为本文探讨的主题。农村基层党组织是党在基层的组织和执政之基，是党联系群众的纽带，是党改革创新的前沿阵地。目前，农村基层党组织出现整体涣散、权责关系不明、党组织工作动力不足等问题，其原因主要是思维观念落后、乡村治理结构固化、监督缺乏、集体经济薄弱等。清新区进行村级党组织建设的机制与制度创新，首先从“顶层设计”党建科学化孵化基地，着重进行治理重心下移、三元主体乡村治理、农村党员提质工程和农村党员诚信体系建设等项目。结合清新党建创新的实践启示，本文提出村级党组织建设创新未来的发展路径，认为创新农村党建应在创新驱动上向内生动力为主发展，在领导方式上向管理服务式发展，在治理方式上向理性法治式发展。