顺铂诱导人肾小管细胞凋亡过程中microRNA表达谱筛选及HIPK2对该凋亡的影响

来源 :北京协和医学院中国医学科学院 北京协和医学院 中国医学科学院 清华大学医学部 | 被引量 : 0次 | 上传用户:kennshi
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
本文主要从以下几个部分展开论述:  第一部分 建立顺铂诱导的人肾小管上皮细胞(HKC细胞)凋亡模型  目的:建立顺铂诱导的HKC细胞凋亡模型,选定下一步实验合适的顺铂浓度。  方法:向对数增长期的HKC细胞加入顺铂使其在培养液浓度分别为2、10和50μM,对照组为同样条件培养不加药组。检测HKC细胞存活率及凋亡率。  结果:HKC细胞存活率随顺铂浓度升高下降,凋亡率随顺铂浓度升高而升高。  结论:成功建立顺铂诱导的HKC细胞凋亡模型;并将10μM顺铂确定为下一步实验所需浓度。  第二部分 顺铂诱导HKC细胞凋亡中microRNA表达谱及生物信息学分析  目的:筛查顺铂诱导HKC细胞凋亡的microRNA差异表达谱及mRNA差异谱,结合生物信息学方法筛选靶基因及构建Pathway-network,miRNAs-GO-network和miRNAs-Gene-network。进一步确定在顺铂诱导HKC细胞凋亡中发挥重要作用的microRNA。  方法:利用Affymetrix Gene Chip miRNA芯片进行差异表达microRNA的筛选,分析获得microRNA差异表达谱;同时利用Affymetrix U133基因表达芯片筛选差异表达mRNA。microRNA靶基因数据库筛选差异microRNA靶基因,联合基因表达芯片结果进一步确定microRNA靶基因。生物信息学分析推测差异表达的microRNA可能具有的生物学功能及参与的机制通路,然后基于microRNA对靶基因的负向性调控, 构建Pathway-network, miRNAs-GO-network和miRNAs-Gene-network。根据以上网络,确定在顺铂诱导HKC细胞凋亡中发挥重要作用的miRNAs。  结果:差异表达的miRNAs聚类分析图结果显示各组组内的样本一致性较好。与对照组相比,实验组microRNA表达差异显著(p<0.05),共筛选出差异性表达的microRNA 47条;Affymetrix U133基因芯片筛选出差异表达基因共3831条。利用microRNA靶基因数据库筛选出差异microRNA的靶基因4760个,与基因芯片结果取交集后最终得到靶基因1181个,如ARHGEF4和BNC2等。进一步通过生物信息学方法得到分析网络:Pathway-network,miRNAs-GO-network和miRNAs-Gene-network,对network进一步分析得出可能在顺铂诱导的HKC细胞凋亡发挥重要作用的microRNAs,如miR-9-3p和miR-371 b-5p。  结论:经顺铂诱导的HKC细胞microRNA表达谱与对照组相比有明显差异;miR-9-3p,miR-371b-5p可能在顺铂诱导的HKC细胞凋亡中发挥作用。  第三部分 HIPK2对顺铂诱导的HKC细胞凋亡的影响  目的:探讨HIPK2对顺铂诱导的HKC细胞凋亡的影响。  方法:首先构建顺铂诱导的HKC细胞凋亡模型,实时荧光定量PCR和Western blot检测HIPK2在不同浓度顺铂诱导的HKC细胞凋亡过程中的表达。其次,设计合成两条HIPK2 siRNA干扰片段,通过脂质体转染HKC细胞,建立HIPK2干扰的细胞株,实时荧光定量PCR和Western blot方法分别检测HIPK2 mRNA和蛋白的表达,再用顺铂处理细胞,Annexin Ⅴ/PI检测细胞凋亡情况。最后,Westernblot检测干扰HIPK2对凋亡相关蛋白bax表达的影响。  结果:顺铂诱导的HKC细胞凋亡过程中HIPK2 mRNA和蛋白表达水平均明显下调(p<0.05),且随着顺铂浓度增高HIPK2表达逐渐降低。转染小干扰RNA后可显著降低HIPK2在HKC细胞内mRNA和蛋白的表达,且HIPK2表达降低后会促进顺铂诱导的HKC细胞凋亡。  结论:HIPK2可抑制顺铂诱导的HKC细胞凋亡。
其他文献
摘要:在新闻报道过程中,作为除当事人以外最接近现场的人,每个记者都有为观众带来“现场”的义务。在这方面,电视新闻有自己独特的优势,通过摄像机、话筒等辅助工具,记者可以通过“声”“画”去呈现现场、还原现场,引导观众去关注现场的细節。然而,很多电视新闻记者进行新闻写作时没有按照电视新闻的规律用镜头去“表达”文字,存在文字逻辑与镜头逻辑“两张皮”的情况,导致新闻现场感大大折扣。本文针对目前电视新闻中所存
计算机网络就是把各个计算机连接到一起,让网络中的计算机可以相互的通信.网络编程就是通过程序实现两台计算机的通信.Python作为最为人性化的程序语言,在网络编程方面相对于
学生的错别字,一直是令老师头痛、学生烦恼、家长揪心的问题,错别字的存在,严重影响了初中生的书面表达、交流和更好的理解生物学重要概念.本文列举初中生物教学中常见的易错
面对日益激烈的竞争,学生学习英语的压力日益增加,我们也需要更加系统的方法来帮助我们的学生更好的学习英语.学生在高中的学习,以巩固型发展为主,所以希望老师们能够采用更
初中的生物学习更多关注的是动植物的物理特性,通过简单的实践操作,会使学生的学习效率更高,记忆更加深刻,同时会使生物课堂更有趣味性,因此实验教学成为学生高效学习的突破,
提高数学教学质量是教育工作者重点分析的问题,在教学阶段要重视质量,这样才能提高有效的数学教学能力,如今教师增加了许多新的教学理念和新的教学方法,在传统的教学方法,合
3D打印技术实际上是利用光固化和纸层叠等技术的快速成型装置.它与普通打印机工作原理基本相同,打印机内装有液体或粉末等“打印材料”,与电脑连接后,通过电脑控制把“打印材
特殊教育归根到底是人文的教育,随着时代文明的发展,国家对教育事业越来越重视,尤其是特殊学生——智障儿童的学习生活,这使得弱势群体的命运得以改变,虽然智障儿童是不幸的,
高中课程改革已经全面展开,历史课堂教学发生了重大改变,但作为教学过程重要环节的作业改革却仍未有大的突破.在以往的高中历史教学中,历史作业往往被师生所忽视,教师布置的
技能鉴定工作是企业“三支队伍”建设的重要工作之一,是释放人才能量、打造核心竞争力的有效手段.本文详细阐述了该国家职业技能鉴定所在市职业技能鉴定指导中心和上级的正确