学校管理是一个需要伦理精神的特殊职业领域。在当前我国社会转型期间利益分配格局调整的复杂背景之下，校长成为学校组织与众多个体和机构产生伦理关系的纽结点，处于复杂伦理关系的中心地位。当校长同时面临两个或两个以上相互冲突的道德规范，而又必须从中作出伦理选择时，便陷入了真实的伦理困境。而校长最终作出的伦理选择，正是他们在利弊权衡之后所作出的一定程度上的利益取舍。这些选择所产生的影响的积极与否，对于能否达成学校管理的整体目标、实现学校管理的伦理意义、实现校长个人更高层次的职业理想等有重要的意义。 学校管理的伦理困境有着十分复杂的形成原因。其中，道德规范的多元性、道德标准的模糊性和非道德主义泛滥是社会道德领域的现实原因；学校所处利益关系复杂化、学校管理显规则与潜规则的冲突以及相关法律制度约束薄弱是学校管理自身存在的原因；校长的角色冲突和学校管理道德观的冲突是校长个人的原因。 学校管理的伦理困境的形成要素包括客观要素和主观要素。校长权力的参与和特定的事件是形成伦理困境的客观要素，校长的心理冲突和心理权衡是形成伦理困境的主观要素。 处于伦理困境之中的校长最终必然要作出一定的伦理选择。伦理选择是校长的学校管理道德观的特殊表现形式；是校长实现道德责任的特殊途径；并为校长提升自身的职业道德水平提供了重要机会。 校长在诸多利益关系之间作出的伦理选择呈现出多种选择模式，主要表现为“学校组织利益为主型”、“校长个人利益为主型”及“相关利益者利益为主型”等三种类型，不同的选择模式各有利弊，具有各自不同的意义。 校长的伦理选择有着理想层次和现实层次的不同要求，达到现实层次的要求，是校长迈向理想层次目标的必由之路。在具体的伦理选择中，校长还需坚持个人利益服从集体利益的原则；目的和手段相统一的原则；伦理价值最大化的原则。 在学校管理过程中，不可能完全避免伦理困境的出现，只能通过创设一些必要的条件，尽可能达到两方面的目标：其一，让当前可能存在的伦理困境在一定程度上得到自然的消解，从而避免一些不必要的伦理冲突以及由此作出的消极选择可能带来的利益损失；其二，引导校长伦理选择的倾向性，使其尽可能作出有积极影响的选择。因此，在个人伦理建设方面，应促进校长伦理价值观念的转型、加强校长的道德自律、提升校长职业理想水平等；在组织和制度伦理的建设方面，应改革校长职业道德教育制度、加强校长职业道德的法制建设和优化校长职业道德赏罚制度等。