南极产木质纤维素酶菌株的筛选及转录组的研究

来源 :山东大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:chenaabb1111
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
南极具有酷寒、烈风、强辐射、低营养等气候特点,储藏了极宝贵丰富的微生物资源。本文以中国第30次南极科学考察采自菲尔德斯半岛区系的10个站位样品为研究对象,系统研究了南极菲尔德斯半岛可培养微生物的种类和数量,初步分析了该区菌株群落的基本特征、分布情况及微生物多样性等。首次从南极环境中筛选出同时产低温纤维素酶和低温木质素酶的细菌,初步探究了其酶活性和降解特性,选取一株具有较高木质纤维素酶活力的细菌,对其进行了转录组测序和功能注释分析。本论文对中国第30次南极科学考察采自菲尔德斯半岛区系的10个站位样品进行了菌株的分离培养、形态学、生理生化和分子鉴定,同时测定其胞外酶活性。从10份采集样品分离筛选的菌株中选取20株细菌和5株真菌进行了序列鉴定,结果表明,在分离得到的20株细菌中,共包含4个门,6个纲,9个属,其中有12株细菌属于变形菌门、γ-变形菌纲、假单胞菌属(Pseudomonas sp.),属于优势菌群;分离得到的5株真菌属于2个门,4个纲,4个属。结果表明南极菲尔德斯半岛不同生境下存在较丰富的微生物多样性。胞外酶的测定结果显示共有6株细菌和3株真菌产纤维素酶,占总菌株的62.5%,本研究筛选的菌株在工业生产中可大幅降低生产成本、节约能源,为极地微生物的应用奠定了基础,积累了资源。通过浓度梯度稀释法、苯胺蓝脱色法、刚果红脱色法的初筛和木质纤维素酶活力测定、检验的复筛,共筛选到产木质素酶的8株细菌和4株真菌,选择其中4株脱色明显的细菌进行木质纤维素酶活力的测定,通过16SrRNA序列鉴定和Blast比对,得出这4株菌分别属于节杆菌属(Arthrobacter sp.)、假单胞菌属(Pseudomonas sp.)、黄杆菌属(Flavobacterium sp.),再选择其中木质素酶活力较高的两株进行纤维素酶活力的测定,最终确定木质纤维素酶活性较高的Pseudomonas sp.E4-1作为研究的目标菌株。筛选获得同时产低温纤维素酶和低温木质素酶的细菌在国内外尚未见报道,为进一步产酶条件优化、酶学性质研究、功能基因克隆等研究奠定了基础。采用高通量技术平台Illumina新的测序仪HiSeq 2000对木质素降解细菌Pseudomonas sp.E4-1进行了转录组测序、拼接组装,用生物信息学的方法对木质纤维素降解酶和多个重要代谢途径相关的基因进行了注释分析。进行功能注释和功能分类,转录组测序表明,共组装2196个unigene,其中注释了1653个KEGG。对预测的unigene进行KO分析,其中注释到与木质纤维素降解相关的酶包括内切葡聚糖酶、α-葡糖苷酶、1,4-p-木糖苷酶、甲苯双加氧酶、谷胱甘肽S-(羟甲基)脱氢酶等,这些能代谢苯环结构的酶很可能在断裂木质素结构中苯环结构间的连接键上发挥作用,为进一步挖掘相关功能基因、克隆功能基因等奠定了基础。
其他文献
我们在做针刺治疗精神系统疾病的时候,发现了对早期情志创伤有重要意义的副脉以及副脉的时间和空间特性,然后发现副脉的这一时空特性也适用于一般的脉诊体系,就把它定义为脉
对美国环境影响评价制度的产生、发展,体系及公众参与等方面进行了阐述。同时,分析了我国环境影响评价制度的内容,在此基础上对我国环境影响评价制度存在的问题提出了对策建议。
自胰岛素用于临床以来,胰岛素制剂的过敏问题就一直存在。持续皮下胰岛素输注已成为一种较方便的脱敏治疗方法。胰岛素泵以调整泵速的形式达到准确微量释放胰岛素的效果,达到
江阴的优势在沿江,沿江的优势在港口。在江阴率先基本实现现代化的新征程中,港口已成为我市经济社会发展的核心战略资源。自江阴市委、市政府启动建设临港新城,全面实施“500天
盾构隧道施工引起的环境土工效应分析一直是隧道及地下建筑工程领域中研究的热点问题。由于目前该领域较少考虑饱和土质以及隧道衬砌与土体间界面排水工况所带来的影响,尤其
X公司宠物饲料包装供应链以中国和越南包装生产厂家为基地,快速、高效满足客户宠物饲料包装订货需求。随着采购量扩大,采购品种逐渐增加,供应链运作过程中原本潜藏的问题逐渐
在英语教育中培养学生的文化认同感,对于推动学生英语专业素养与中国优秀文化传播成效的协同提升具有重要意义,为此,高校英语教育工作需要重视在教育实践中开展文化认同感培
回族的分布范围很广 ,城市化水平也很高 ,但围清真寺而居的特点极为普遍 ,这样的居住区域被称为Jamaat,它是中国回族赖以形成的基础之一 ,也是伊斯兰文化与中国传统社会相结
铜矿整体品位下滑情况突出$$智利是世界上铜矿资源最丰富的国家,同时也是世界上开采铜和出口铜最多的国家,在世界铜产业链上具有重要的地位。以铜矿为主,整个矿业开采和出口占据
报纸
《中国心血管病报告2018》显示,中国心血管疾病死亡率居各病因之首,占居民全部死因的40%以上,高血压是心血管疾病的首位危险因素。根据最早公开的资料显示,新型冠状病毒肺炎(