冠心病环状RNA表达谱及其诊断价值分析

来源 :北京协和医学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:emajor
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
背景和目的冠心病(coronary artery disease,CAD)作为世界及我国首要死亡因素,严重威胁公共健康。虽然目前存在有效的冠心病治疗手段,但其死亡率仍居高不下,造成这种差异的原因之一是缺乏对冠心病高度敏感和更便捷的诊断方法。近年来研究表明,环状RNA(circularRNA,circRNA)与CAD的发生、发展密切相关,且circRNA良好的稳定性可以使其成为CAD的生物标志物。本研究应用circRNA微阵列芯片技术检测CAD病例及对照外周血单个核细胞中circRNA的表达谱,筛选差异性表达的circRNA,评估其作为CAD诊断的生物标志物的可能性。对象和方法通过circRNA芯片检测24例冠心病患者及7例对照PBMCs中circRNA表达谱,以表达差异倍数大于等于1.5倍,P值小于0.05为标准筛选差异性表达的circRNA,并用 TargetScan 和 miRanda 预测 circRNA 与微小 RNA(microRNA,miRNA)的结合关系。通过使用注释及可视化数据库对差异表达基因进行基因本体论(gene ontology,GO)功能注释及基因和基因组通路富集分析(kyoto encyclopedia of genes and genomes pathways,KEGG)。使用六种分选器筛选诊断CAD最优的circRNA组合标签,以及搜索既往研究中报道可能与CAD相关的circRNA作为验证circRNA,在独立大样本中(412例CAD患者及290例对照)验证circRNA表达水平。使用Spearman相关分析验证的circRNA与心血管传统因素、传统CAD标志物及心功能参数的相关性,利用单变量及多变量Logistic回归方程评估验证的circRNA是否为CAD独立影响因素,采用受试者工作特征曲线分析circRNA诊断效率,综合评价circRNA作为CAD标志物的可能性。检测三个circRNA在人体多组织及多细胞系中表达水平。结果在circRNA芯片表达谱分析中,与对照相比,CAD病例中一共有624个circRNA显著上调,171个circRNA显著下调。分选器筛选出9个circRNA组合标签可较好诊断 CAD,包括 hsacirc001879,hsacirc0066609,hsacirc0073402,hsacirc0091846,hsacirc0078625,hsacirc0066608,hsacirc004104,hsacirc004432 和 hsacirc007142。既往研究中的 circTCF25,hsacirc005075和hsacirc1569可能与CAD相关。在独立样本中,我们选取hsacirc001879,hsacirc004104,hsacirc004432,hsacirc007142,circTCF25,hsacirc005075和hsacirc1569进行验证。结果显示,与对照相比,hsacirc001879 和 hsacirc004104 在病例中显著上调(P<0.05),circTCF25 显著下调(P<0.05)。逻辑回归分析结果显示,hsacirc001879,hsacirc004104和circTCF25每升高一个单位,CAD发病的调整后优势比(odds ratios,OR)分别为 1.58(95%CI 为 1.29-1.93,P<0.001),2.53(95%CI 为 1.68-3.81,P<0.01)和 0.55(95%CI 为 0.39-0.77,P<0.001)。hsacirc001879,hsacirc004104 和circTCF25 的 ROC 曲线下面积分别为 0.70(95%CI 为 0.66-0.75,P<0.001),0.70(95%CI 为 0.65-0.76,P<0.001)和 0.62(95%CI 为 0.57-0.67,P<0.001)。三个circRNA在心血管相关细胞系中表达量较高,circTCF25在心血管相关组织中表达量较高。结论本研究系统分析了 CAD患者的circRNA表达谱,并在独立样本中验证了hsacirc001879 和 hsacirc004104 在 CAD 病人中显著上调,circTCF25 显著下调。结果提示 hsacirc001879、hsacirc004104 和 circTCF25 可能成为 CAD 新的circRNA生物标志物,为CAD诊治提供了新的思路。
其他文献
<正>为拥有油源的石油企业做好信息、技术、设备服务,这可能是除少数民营油企可以拥有油源继续生存外,大多数既不想转行、又想要生存下去的民营油企的又一选择。在油价高涨的
<正>数学竞赛解题是数学教学解题中最精采、难度最大、数学思维最核心、数学思想最广泛、方法最集中,容易培养尖子的园地.什么是数学美呢?它就是数学的优美感.数学家庞加莱说
员工满意度管理是现代企业管理的一项重要内容,加强员工满意度的管理,提高员工满意度是企业战略发展的需要。在强调中小企业员工满意对于企业发展重要性基础上,提出了几个与
按照个性心理学的观点,"人人都有自卑感",但并非每一个体都有自卑情结。自卑情结是经自己"夸张了的自卑感",它是人的行为方式的决定力量。秦观是文学史上一个具有自卑情结的
机体大强度或不习惯的运动,尤其是离心运动,常常会引起肌肉的延迟性酸痛,并在运动后的2~3天达到高峰,伴有一系列的肌肉结构、组织学及生物化学的改变,严重时会影响到人们体育
近年来,二维过渡金属二硫族化合物(TMDs)引起了人们极大的研究兴趣。由于其独特的性质,人们在TMDs中发现了很多新奇的物理现象,并探索了其各种潜在的器件应用。载流子调控在半
《绝爱1989》是日本著名漫画家尾崎南的代表作,她的作品多次被拍摄成动画TV版和电影OVA版,其豪放的情欲表达和强烈的爱情唯我主义使其成为日本漫坛的翘楚,促进了动漫艺术的多
当事人原告:北京北大方正集团公司(简称北大方正公司)原告:北京红楼计算机科学技术研究所(简称红楼研究所)
在CC-NUMA架构系统中,为了减少缓存一致性维护的开销,大规模CC-NUMA系统通常采用多级缓存一致性域设计,降低平均一致性维护操作数量,从而有效缓解系统性能扩展与一致性维护开销的
在沟壑治理工程布置过程中,存在着单纯拦截、贮蓄的现象,缺乏完全理论研究与指导.甚至水土保持技术文件也存在片面性,导致基层实施单位"年年筑坝年年垮、数量升级无实存".根